核心结论：若补充协议已签好但施工方不同意，可先尝试协商沟通，协商不成则根据协议约定和法律规定，通过仲裁或诉讼解决争议。以下为具体情况分析：

1. 协商沟通
   • 沟通目的：首先，建议与施工方进行友好、坦诚的沟通。了解他们不同意补充协议的具体原因，是因为对某些条款的理解存在偏差，还是基于自身利益考虑有不同诉求。例如，补充协议中可能涉及到工程款的支付方式、工期调整等内容，施工方可能认为这些条款对其不利。
   • 沟通方式：可以通过面对面会议、电话沟通或者书面函件等方式进行。在沟通中，要保持冷静和理性，避免情绪化的争吵，以寻求双方都能接受的解决方案。比如，如果施工方认为工期调整过于紧张，影响其施工进度和成本，你可以与他们一起探讨是否有合理的调整方案，如适当延长工期或者增加一定的补偿措施。
2. 依据协议约定处理
   • 查看协议条款：仔细审查补充协议中关于争议解决的条款。很多协议会约定在出现争议时，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以提交仲裁机构进行仲裁或者向有管辖权的人民法院提起诉讼。例如，如果协议中明确约定了仲裁条款，那么双方就需要按照该条款的约定，将争议提交给指定的仲裁机构进行仲裁。
   • 遵循约定程序：如果协议中有明确的争议解决程序，那么双方都应遵循该程序来处理争议。如果一方违反约定，擅自采取其他方式解决争议，可能会面临不利的法律后果。比如，在约定了仲裁条款的情况下，一方却直接向法院起诉，另一方可以在首次开庭前提出管辖权异议，要求法院驳回起诉，将案件移送至约定的仲裁机构进行仲裁。
3. 法律途径解决
   • 仲裁：如果双方在协议中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁具有专业性、高效性和保密性等特点。仲裁机构会根据双方提供的证据和法律规定，作出具有法律效力的裁决。例如，中国国际经济贸易仲裁委员会、各地的仲裁委员会等都可以受理相关的仲裁案件。
   • 诉讼：如果没有约定仲裁条款或者仲裁协议无效，那么可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，需要提交相关的证据材料，如补充协议、沟通记录、施工过程中的相关文件等，以证明自己的主张。法院会根据事实和法律规定，作出判决。例如，如果是因为补充协议中工程款支付问题产生争议，你需要提供证据证明施工方已完成的工作量以及应支付的款项，而施工方则需要提供相反的证据进行反驳。

在处理此类问题时，如果情况较为复杂或者涉及金额较大，建议及时收集和整理相关证据，以便在后续的协商、仲裁或诉讼中维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。