工程验收单的最终归属并非固定由乙方持有，而是根据合同约定、行业惯例及实际履行情况来确定。以下从不同角度对此问题进行分析：

1. 合同约定优先：

   • 在建设工程合同中，双方通常会就工程验收单的签署、传递、保存等事项作出明确约定。如果合同中明确规定了工程验收单最终应由乙方（施工单位）保存，那么乙方自然有权持有该验收单。
   • 反之，如果合同约定工程验收单应由甲方（建设单位）或其他相关方保存，或者未明确约定归属，则不能简单地认为工程验收单应归乙方所有。

2. 行业惯例与实际操作：

   • 在建设工程领域，工程验收单是工程竣工验收的重要文件，它记录了工程的质量、安全、功能等方面的验收情况。虽然行业惯例可能倾向于由施工单位（乙方）在验收过程中准备并提交验收单，但验收单的最终归属并不因此固定。
   • 实际操作中，验收单可能需要在多个部门或单位之间流转，如建设单位、监理单位、施工单位、档案馆等。最终，验收单可能会根据实际需要被保存在具有管理职责或档案保存义务的单位或个人手中。

3. 法律后果与风险：

   • 如果工程验收单丢失或损坏，可能会对工程的后续维护、保修、结算等产生不利影响。因此，无论验收单最终归谁所有，相关方都应妥善保管，并确保其完整性和可追溯性。
   • 如果因验收单的保管问题导致纠纷或损失，相关方可能需要根据合同约定或法律规定承担相应的法律责任。

4. 建议与措施：

   • 对于乙方而言，如果合同未明确约定验收单的归属，建议在验收过程中与甲方协商确定验收单的保存方式和地点，并确保双方对验收单的保管有明确的了解和共识。
   • 同时，乙方也可以考虑在验收单上注明“本验收单一式多份，甲乙双方各执一份”等类似条款，以明确双方的权利和义务。
   • 在实际操作中，乙方还可以将验收单进行复印或扫描备份，以防原件丢失或损坏。

总结来说，工程验收单的最终归属并非固定由乙方持有，而是应根据合同约定、行业惯例及实际履行情况来确定。如果对此有疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。