地方政府不允许个人办理网约车运输证，这一行为的合法性不能一概而论，需要结合具体的地方性法规和政策来判断。以下从几个角度进行详细分析：
国家层面的法律规定：
- 根据《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》等相关国家层面的法规，网约车作为一种新兴的出行方式，其合法性已经得到了确认。这些法规主要规定了网约车平台、车辆和驾驶员的准入条件，以及运营过程中的安全、服务质量等方面的要求。
- 国家层面并未明确禁止个人办理网约车运输证，而是规定了相应的条件和程序，只要符合这些条件和程序，个人是可以办理网约车运输证的。
地方性法规和政策的影响：
- 地方政府在执行国家层面法规的同时，有权根据本地的实际情况制定地方性法规和政策。这些地方性法规和政策可能会对网约车的准入条件、运营区域、数量控制等方面做出更具体的规定。
- 如果地方政府出于交通管理、城市规划、环境保护等方面的考虑，认为需要限制或禁止个人办理网约车运输证，那么它可以通过制定地方性法规或政策来实现这一目的。但这样的限制或禁止必须合法、合理，并且符合上位法的规定。
合法性判断的关键点：
- 是否符合上位法：地方政府制定的地方性法规和政策不得与国家层面的法规相抵触，否则将因违法而无效。
- 是否合理必要：即使地方政府有权制定限制或禁止个人办理网约车运输证的规定，这样的规定也必须基于合理、必要的考虑，不能滥用权力或歧视性对待个人。
- 是否经过合法程序：地方政府在制定地方性法规和政策时，必须遵循法定的程序，如公开征求意见、听证会等，确保公众的参与和知情权。
实际操作中的建议：
- 了解地方政策：如果你打算办理网约车运输证，首先需要了解你所在地方政府的具体政策和规定。这可以通过查询政府官方网站、咨询相关部门或专业人士等方式获取。
- 评估自身条件：在了解地方政策的基础上，评估自己是否符合办理网约车运输证的条件。这包括车辆条件、驾驶员条件等方面。
- 依法申请办理：如果你符合条件，并且地方政府没有禁止个人办理网约车运输证的规定，那么你可以依法向相关部门申请办理。在申请过程中，需要按照要求提交相关材料，并遵守相关的程序和规定。
如果地方政府不允许个人办理网约车运输证，并且这一规定合法、合理且经过合法程序制定，那么这一行为是合法的。但如果你认为这一规定违法、不合理或未经过合法程序制定，你可以通过法律途径进行维权，如向相关部门提出异议、申请行政复议或提起行政诉讼等。
如果你有任何关于网约车运输证办理或相关法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。