结论：二审法院在发现一审法院依据超过诉讼时效驳回诉讼请求存在错误时，通常不会直接发回重审，而是会根据具体情况进行改判或维持原判，并可能就诉讼时效问题进行重新审查。
分析说明：
二审法院的裁判权：
- 二审法院在审理上诉案件时，有权对一审法院的判决进行全面审查，包括事实认定和法律适用。
- 如果二审法院认为一审法院的判决存在错误，它有权直接改判，而不是必须发回重审。
诉讼时效问题的处理：
- 诉讼时效是法律规定的请求权行使的时间限制，超过诉讼时效的请求权通常不受法律保护。
- 然而，诉讼时效的适用并非绝对，存在多种例外情况，如诉讼时效的中断、中止等。
- 如果二审法院认为一审法院对诉讼时效的认定存在错误，它会对诉讼时效问题进行重新审查，并根据审查结果作出相应判决。
发回重审的适用条件：
- 发回重审通常适用于一审法院在审理过程中存在严重违反法定程序的情况，如遗漏当事人、违法缺席判决等。
- 单纯因为一审法院对诉讼时效的认定错误，并不构成发回重审的充分理由。
特殊场景：
- 如果一审法院在审理过程中存在其他严重违反法定程序的情况，且这些情况与诉讼时效的认定错误相互交织，影响了案件的公正审理，二审法院可能会考虑发回重审。但这种情况相对罕见，且需要具体分析。
行动建议：
- 如果当事人认为一审法院依据超过诉讼时效驳回诉讼请求存在错误，应在上诉期内及时提起上诉，并在上诉状中明确指出一审法院的错误及理由。
- 在二审过程中，当事人应积极配合法院的审理工作，提供相关证据和法律依据，以支持自己的上诉请求。
- 如果二审法院的判决仍然不符合当事人的预期，当事人还可以考虑申请再审或寻求其他法律救济途径。
法律依据：
- 《中华人民共和国民事诉讼法》第一百七十七条：“第二审人民法院对上诉案件，经过审理，按照下列情形，分别处理：……（三）原判决认定基本事实不清的，，裁定撤销原判决，发回原审人民法院重审，或者查清事实后改判；（四）原判决遗漏当事人或者违法缺席判决等严重违反法定程序的，裁定撤销原判决，发回原审人民法院重审。……”。虽然该条款未直接涉及诉讼时效问题，但明确了二审法院在审理上诉案件时的裁判权和发回重审的适用条件。在处理诉讼时效问题时，二审法院会依据相关法律规定和案件具体情况进行综合判断。