破产管理人对超过诉讼时效的债务，原则上不得行使权利要求清偿，但存在例外情形需根据具体情况处理。以下从不同角度展开分析：

一、诉讼时效届满的法律后果

根据《民法典》第192条，诉讼时效期间届满后，义务人可以提出不履行义务的抗辩，权利人丧失胜诉权，但实体权利本身并不消灭。在破产程序中，这一规则同样适用：

1. 管理人无权主动追索：若债务已超过诉讼时效，管理人不得以债权人名义提起诉讼或申请仲裁要求清偿，否则可能因债务人提出时效抗辩而败诉。
2. 债务人可主张抗辩：若管理人未审查时效问题直接申报债权，债务人（如破产企业自身或其他连带债务人）可在破产程序中提出时效抗辩，导致该债权被驳回。

二、例外情形：债务人自愿履行的处理

若债务人（破产企业）自愿放弃时效利益（如书面承诺还款、实际履行部分债务等），管理人需分情况处理：

1. 已实际履行的部分：根据《民法典》第192条第2款，债务人自愿履行的，不得请求返还。管理人应将已履行部分纳入破产财产分配，但需留存证据（如转账记录、书面确认文件）以备核查。
2. 未履行但承诺还款的：若债务人出具书面还款计划或承诺，可能构成对时效利益的放弃。管理人可依据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第19条，将该债权认定为有效债权并申报，但需承担举证责任（如债务人签字确认的文件、录音录像等）。

三、管理人的审查义务与程序要求

1. 主动审查时效：管理人接管债务人财产后，必须对所有申报债权进行时效审查，避免因未尽审查义务导致破产财产不当减少。
2. 异议处理程序：若管理人认定债权超过时效，应书面通知债权人并说明理由。债权人不服的，可依据《企业破产法》第58条向法院提起债权确认之诉，由法院最终裁决。
3. 瑕疵债权的处理：对部分超过时效但可能通过其他方式（如债务人自愿履行、时效中断事由）补救的债权，管理人可暂缓认定，要求债权人补充证据后再行处理。

四、实务建议

1. 完善证据留存：管理人应要求债权人提供债权形成、催收、债务人确认等全链条证据，重点核查是否存在时效中断、中止事由（如债务人同意履行、债权人提起诉讼等）。
2. 分类管理债权：对超过时效的债权，可单独列明并标注风险，在破产财产分配方案中明确说明其可能无法受偿的风险。
3. 谨慎处理承诺文件：若债务人出具还款承诺，管理人需核实其真实性及是否构成对时效利益的放弃，必要时可要求债务人股东会或董事会决议确认。

总结：破产管理人对超过诉讼时效的债务，原则上应排除在清偿范围外，但需严格审查是否存在债务人自愿履行、时效中断等例外情形。管理人未尽审查义务或错误处理时效问题的，可能承担法律责任。如有具体案例或证据材料，可进一步向我咨询以制定针对性方案。