工伤职工的停工留薪期主要由用人单位根据工伤协议医疗机构出具的诊断证明，并参照《工伤职工停工留薪期分类目录》来确定。以下是对这一问题的详细解答：
一、确定主体与依据
确定主体：
- 停工留薪期的确定主体是用人单位。用人单位在收到工伤职工就诊的工伤协议医疗机构出具的诊断证明后，会结合《工伤职工停工留薪期分类目录》（以下简称《目录》）来初步确定停工留薪期。
主要依据：
- 诊断证明：医疗机构根据工伤职工的伤情出具的诊断证明是确定停工留薪期的重要依据。诊断证明中会明确伤情的具体情况和治疗建议，为用人单位确定停工留薪期提供参考。
- 《目录》规定：《目录》对各类工伤对应的停工留薪期有明确规定。例如，对于手指离断伤，根据不同的手指和离断程度，规定了1-3个月不等的停工留薪期；对于常见的骨折，如胫骨骨折，一般规定6-9个月的停工留薪期。用人单位在确定停工留薪期时，应参照《目录》的规定进行。
二、具体确定流程
初步确定：
- 工伤职工发生工伤后，应及时前往工伤协议医疗机构进行救治。医疗机构会根据职工的伤情出具诊断证明，明确伤情的具体情况和治疗建议。
- 用人单位在收到诊断证明后，对照《目录》，结合职工的实际伤情，初步确定停工留薪期。例如，职工被诊断为腰部扭伤，根据《目录》，腰部扭伤的停工留薪期一般为1-2个月，用人单位可据此初步确定为1个半月。
延长处理：
- 如果工伤职工所受伤害在《目录》中未列明具体停工留薪期，或者实际伤情比《目录》规定的情形更严重、更复杂，导致停工留薪期需要延长的，用人单位应当凭工伤协议医疗机构出具的休假证明，向市劳动能力鉴定委员会申请确认。
- 例如，工伤职工因特殊的工作事故导致多处复合伤，在《目录》中没有完全对应的情况，且医疗机构认为需要更长时间的治疗和休养，此时用人单位就需要按照规定申请确认延长停工留薪期。
争议解决：
- 若工伤职工与用人单位就停工留薪期的确定存在争议，任何一方都可以向市劳动能力鉴定委员会提出确认申请。市劳动能力鉴定委员会将根据专业知识和相关规定，对停工留薪期进行合理确认。
三、期限限制
- 停工留薪期一般不超过12个月。这是为了保障劳动关系的相对稳定性和企业的正常运营秩序。
- 如果伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。也就是说，工伤人员停工留薪期的最长期限原则上不超过24个月。
四、法律后果与建议
- 法律后果：如果用人单位未按照规定确定停工留薪期，或者未按时支付工伤职工在停工留薪期内的工资福利待遇，可能会面临劳动争议和法律责任。
- 建议：对于工伤职工和用人单位来说，应严格按照规定确定停工留薪期，并确保工伤职工在停工留薪期内的合法权益得到保障。如果存在争议或疑问，应及时咨询专业律师或相关机构以获取准确和专业的解答。
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