公司体检不合格并不直接构成开除员工的合法理由，是否会被开除需综合考虑多方面因素。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况分析
劳动合同与规章制度：
- 如果劳动合同中没有特别约定，且公司规章制度中也没有明确将体检不合格列为严重违反公司规定的情形，那么仅因体检不合格通常不能成为单位开除员工的合法依据。体检结果并不必然影响员工的工作能力和业绩，单位随意以此开除员工可能涉嫌违法解除劳动合同。
沟通与协商：
- 在体检不合格的情况下，单位应与员工进行充分沟通，了解员工的身体状况和治疗进展，为员工提供必要的支持和帮助。双方可以协商调整工作岗位、提供治疗时间或采取其他合理措施，以保障员工的合法权益和工作安全。
二、特殊情况分析
岗位有特定健康要求且事先明确告知：
- 若工作岗位对身体健康有明确、合理的要求，并在招聘时已向员工明确说明，员工体检不合格不符合该岗位健康标准的，公司可以解除劳动合同。例如，食品行业对传染性疾病有限制，高空作业人员不得有高血压等。但公司需确保在招聘时已将健康要求作为录用条件之一，并有证据证明已明确告知员工。
试用期内且体检结果影响录用条件：
- 如果员工处于试用期，且公司在招聘时已将体检合格作为录用条件之一，员工体检不合格未达到该条件的，公司可以依据《劳动合同法》关于试用期解除劳动合同的规定辞退员工。但公司需有证据证明其在招聘时明确将体检合格作为录用条件，以及员工不符合该条件的具体情况。
医疗期满无法胜任工作：
- 员工已经入职，在公司年度体检中检查不合格，或因病不能胜任原工作也不能从事另行安排的工作，且医疗期满的，公司可以辞退员工，但需依法支付经济补偿金。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条，有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的。
传染性疾病或严重精神类疾病：
- 如活动性肺结核等空气传播疾病，因其强传染性，可能威胁其他员工健康，单位在保护公共卫生安全的前提下，若员工在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作，可能会考虑辞退。但员工治愈后，单位应恢复其工作。
- 精神分裂症等导致患者无法正常履行工作职责的疾病，若员工不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，单位可遵循法定程序辞退。
三、经济补偿与辞退流程
经济补偿的计算方式：
- 经济补偿按员工在本公司工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。如果员工月工资高于公司所在地区上年度员工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准是员工月平均工资的三倍，最高不得超过十二年。
违法辞退的赔偿：
- 如果公司违法辞退体检不合格的员工，员工有权要求公司支付赔偿金，赔偿金的标准通常是经济补偿标准的二倍。
辞退流程：
- 单位在决定辞退员工时，应确保处理程序的合法性和公正性。首先，应与员工进行协商，探讨是否可以通过调整工作岗位、提供治疗时间等方式解决问题。若经过治疗或调整工作岗位后，员工仍无法胜任工作，单位在考虑辞退员工时，需遵循《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，支付相应的经济补偿金。
总结来说，公司不能仅凭体检不合格就随意辞退员工，而需考虑体检结果与工作岗位的关联性、是否事先告知健康要求、员工是否处于试用期等因素，并遵循法定程序。员工在面对此类情况时，也应了解自己的权益和可能的解决方案，积极与单位进行沟通协商。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。