申请劳动能力鉴定时，人社局通知到科室进行鉴定是合理的。以下是详细分析：

1. 劳动能力鉴定的法定程序
   根据《工伤保险条例》第二十五条，劳动能力鉴定由设区的市级劳动能力鉴定委员会组织，通常由医疗卫生专家库中随机抽取的专家组成专家组进行。实际操作中，专家组可能以科室形式开展工作（如骨科、神经科等专科评估），这是为了确保鉴定结论的专业性和准确性。因此，人社局通知到具体科室鉴定，符合程序要求。

2. 科室鉴定的合理性依据

   • 专业分工：劳动能力鉴定需针对工伤职工的具体伤情（如肢体功能、神经损伤等），由对应科室专家评估更科学。例如，骨折伤情由骨科专家鉴定，视力损伤由眼科专家鉴定。
     
   • 效率与规范：科室鉴定能集中专家资源，避免重复检查，同时符合《劳动能力鉴定管理办法》中“鉴定结论需由专家组签署意见”的规定。
     
   • 透明性：鉴定过程通常要求至少2名专家参与，科室鉴定不改变这一要求，且鉴定结论需经劳动能力鉴定委员会审核，程序合法。

3. 需注意的例外情形
   若存在以下情况，可能需进一步核实程序合法性：

   • 未提前告知：人社局未书面或口头说明鉴定科室及专家信息，可能侵犯知情权；
     
   • 专家资质存疑：参与鉴定的专家未列入当地医疗卫生专家库，或与伤情无关（如让皮肤科专家鉴定骨折）；
     
   • 程序违规：鉴定过程未录音录像、未允许用人单位或职工代表在场，或未出具书面结论。
     

建议：若对鉴定程序有疑问，可要求人社局出示《劳动能力鉴定专家组组成通知》、专家资质证明及鉴定结论书。如发现程序违法，可依据《工伤保险条例》第二十六条申请再次鉴定。如有具体疑问，欢迎进一步向我咨询。