当医院财产不足以全额清偿员工债权时，员工可通过以下途径保障自身权益：

1. 优先受偿权
   根据《企业破产法》第113条，员工债权（如工资、医疗/伤残补助、抚恤费用、基本养老保险/医疗保险费用及经济补偿金）在破产财产清偿中享有优先于普通债权的地位。具体顺序为：

   • 破产费用和共益债务优先清偿；
     
   • 员工债权（包括欠付的工资、社保、补偿金等）作为第一顺位清偿；
     
   • 剩余财产再按比例清偿普通债权（如供应商货款、借款等）。
     操作建议：员工需及时向破产管理人申报债权，并提交劳动合同、工资条、社保记录等证据，确保债权被依法确认。

2. 参与破产程序监督
   若医院进入破产清算或重整程序，员工可通过以下方式维护权益：

   • 债权人会议：员工可作为债权人代表参与会议，对破产财产分配方案、重整计划等事项行使表决权；
     
   • 管理人监督：要求管理人定期公开财产清查、债权审查进度，防止财产被隐匿或低价处置；
     
   • 异议权：对管理人确认的债权金额、清偿顺序有异议时，可向法院提起债权确认之诉。
     风险提示：若员工未及时申报债权，可能丧失受偿资格，需在法院公告的债权申报期限内主动主张权利。

3. 申请社会保险垫付（特定情形）
   若医院欠缴社保导致员工无法享受待遇（如医保报销、养老金领取），员工可：

   • 向当地社保部门申请先行支付（需符合《社会保险法》第41条条件，如医院被吊销执照、逃匿等）；
     
   • 社保部门垫付后，将依法向医院追偿，员工权益不受影响。
     注意：此途径仅适用于社保类债权，工资等普通债权不适用。

4. 追究相关责任人连带责任（如存在恶意转移财产）
   若医院控股股东、实际控制人存在以下行为，员工可要求其承担连带清偿责任：

   • 隐匿、转移财产逃避债务；
     虚构债务或承认不真实债务；
     无偿转让财产、以明显不合理价格交易等。
     操作路径：向法院申请撤销上述行为（破产撤销权），或直接起诉责任人要求赔偿。

总结：员工应优先通过破产程序申报债权并主张优先受偿权，同时积极参与债权人会议监督财产分配。若发现医院存在恶意逃债行为，可依法追究责任人连带责任。具体操作需结合医院破产进度及证据情况，建议员工及时委托律师介入以最大化权益。