结论前置：正在进行劳动仲裁期间，一般不能直接申请公司减少注册资本，但公司仍可依法定程序进行减资，不过需特别注意对劳动者权益的保护及可能面临的法律风险。以下分情况详细说明：

1. 减资的法定程序与限制
   根据《公司法》第一百七十七条，公司减少注册资本需履行严格程序：

   • 编制资产负债表及财产清单；
     
   • 自作出减资决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告；
     
   • 债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，有权要求公司清偿债务或提供相应担保。
     若公司未依法履行上述程序，可能面临行政处罚（如工商部门责令改正、罚款）及对债权人的赔偿责任。劳动仲裁中，劳动者作为潜在债权人（如涉及工资、经济补偿等债权），公司减资时未通知或未清偿债务的，劳动者可主张减资行为无效或要求公司承担赔偿责任。

2. 劳动仲裁期间减资的特殊风险

   • 恶意减资规避债务：若公司明知存在劳动仲裁案件，仍通过减资转移资产、逃避债务，可能被认定为“恶意减资”。此时，劳动者可依据《公司法》第二十条（股东滥用权利逃避债务）或《民法典》相关规定，要求股东在减资范围内对公司债务承担连带责任。
     
   • 减资与仲裁结果的关联性：若劳动仲裁裁决公司需支付劳动者款项（如工资、赔偿金），而公司已通过减资导致资产不足清偿，劳动者可在执行阶段申请追加股东为被执行人，或直接起诉股东要求承担补充赔偿责任。

3. 实务建议

   • 对劳动者：若发现公司正在减资，应立即向仲裁机构或法院申请财产保全，冻结公司资产；同时关注减资公告，及时主张债权。
     
   • 对公司：减资前应全面评估未决劳动仲裁可能产生的债务，确保减资后公司资产仍足以清偿；若减资后资产不足，建议股东提供担保或预留清偿资金，避免法律风险。

总结：劳动仲裁本身不直接禁止公司减资，但减资程序需严格依法进行，且不得损害劳动者权益。若公司试图通过减资逃避劳动仲裁债务，劳动者可通过法律途径追究股东责任。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。