核心结论：保险公司仅报销45天休假而医院开具三个月休假证明存在争议，需结合保险条款、医疗规范及实际伤情综合判断，您有权通过协商、鉴定或诉讼主张合理休假时长。以下是具体分析：

一、保险公司报销天数的依据需核查

1. 保险条款的约定
   保险公司通常依据保险合同中“误工费赔偿标准”或“医疗期限制”条款确定赔偿天数。若条款明确规定“单根肋骨骨折最多赔偿45天”，则保险公司可能以此为由拒赔超出部分。但需注意：

   • 条款是否属于格式条款（即未与您协商、单方制定的条款）；
     
   • 条款是否违反《保险法》第19条（如免除保险公司依法应承担的义务或加重投保人责任）。
     若条款存在上述问题，您可主张该条款无效。

2. 保险公司内部理赔标准
   部分保险公司会参考《人身损害误工期、护理期、营养期评定规范》（GA/T 1193-2014）等规范制定内部标准。根据该规范，单根肋骨骨折的误工期通常为30-45天，但若存在并发症（如血胸、气胸）或需手术治疗，误工期可延长至60-90天。
   建议：要求保险公司提供其依据的具体规范或标准，并核对是否与您的实际伤情匹配。

二、医院休假证明的效力需确认

1. 医疗机构的诊断权限
   医院开具的休假证明需基于您的实际伤情和康复需求。若医生认为您需要三个月休息（如因疼痛、活动受限或需定期复查），则休假证明具有合法性。
   注意：若保险公司质疑休假时长，可要求其委托第三方司法鉴定机构对误工期进行鉴定。

2. 休假证明的合理性
   若医院未详细记录伤情（如未提及并发症或治疗方式），保险公司可能以“证明缺乏依据”为由拒赔。此时，您可补充提供：

   • 病历、检查报告（如X光片、CT）；
     
   • 医生出具的病情说明（明确休息原因及必要性）；
     
   • 复查记录（证明康复进度未达预期）。

三、您的权利与应对措施

1. 协商解决
   向保险公司提出书面异议，附上医院证明及补充材料，要求重新核定赔偿天数。若保险公司坚持原决定，可要求其出具书面拒赔通知，并注明依据。

2. 投诉或调解
   若协商无果，可向当地银保监会投诉（电话12378），或通过保险行业协会调解委员会申请调解。

3. 诉讼途径
   若争议仍无法解决，可向法院起诉，主张保险公司按实际误工期赔偿。法院会综合医院证明、保险条款、鉴定意见等证据作出判决。
   关键点：诉讼中需证明医院休假证明的合理性（如通过鉴定或专家证人）。

四、特殊情况提示

若您因车祸同时涉及交通事故责任纠纷（如对方全责），可同时向肇事方主张误工费赔偿。此时，误工期以医院证明或鉴定意见为准，不受保险条款限制。

总结：保险公司拒赔超出45天的部分需有合法依据，您可通过补充证据、协商、投诉或诉讼维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。