公司通过微信发放工资，从法律合规及风险防范角度，建议签署书面证明文件，具体分析如下：

1. 法律层面无强制性规定，但存在风险
   根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位应将工资支付给劳动者本人，并可要求劳动者在工资支付表上签字确认。法律未明确禁止通过微信等电子方式发放工资，但未签署书面证明可能导致以下风险：

   • 举证困难：若发生劳动争议（如拖欠工资、克扣工资），公司需证明已足额支付工资。微信转账记录虽可作为证据，但需满足以下条件：
     
     • 转账账户为劳动者本人实名账户；
       
     • 转账备注明确标注“工资”及具体月份；
       
     • 结合其他证据（如考勤记录、工资条）形成完整证据链。
       
   • 劳动者否认风险：若劳动者主张转账为借款、报销或其他费用，公司可能因缺乏书面证明而承担不利后果。

2. 建议签署的证明文件及内容
   为降低风险，公司可要求劳动者签署以下文件：

   • 《工资发放确认书》：明确约定工资发放方式（微信转账）、账户信息、金额、发放周期，并由劳动者签字确认。
     
   • 《电子支付同意书》：劳动者书面同意公司通过微信等电子方式支付工资，并确认账户为本人所有。
     
   • 工资条：每月通过微信发送电子工资条，注明工资构成（基本工资、绩效、加班费等）、扣款项（社保、个税等），并要求劳动者回复“已确认”或签字后拍照回传。

3. 实务操作建议

   • 保留转账记录：公司应定期导出微信转账记录，并加盖电子数据存证平台（如“可信时间戳”）的认证章，确保证据效力。
     
   • 完善劳动合同条款：在劳动合同中明确约定工资发放方式为“微信转账”，并注明劳动者需配合签署相关确认文件。
     
   • 避免现金混合发放：若部分工资通过微信发放、部分通过现金发放，需分别签署确认文件，防止混淆。

总结：公司通过微信发放工资虽不违法，但为规避举证风险，建议签署书面确认文件并完善证据留存。如有进一步疑问，可直接向我咨询劳动法相关问题。