关于定向医生已到单位上班后是否还能主张违约金的问题，这主要取决于定向培养协议中的具体约定以及相关法律法规的规定，以下分情况讨论：
若定向培养协议中有明确约定违约金条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定：
- 在这种情况下，如果医生已经按照协议约定完成了定向培养，并到单位上班，但之后出现了协议中约定的可以主张违约金的情形（如医生提前离职、违反服务期约定等），那么单位有权根据协议约定向医生主张违约金。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。但约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
若定向培养协议中没有明确约定违约金条款，或者约定的违约金条款违反法律法规的强制性规定：
- 在这种情况下，单位通常无法直接向医生主张违约金。因为违约金的约定需要双方自愿、平等、公平，且不得违反法律法规的强制性规定。如果协议中没有约定，或者约定无效，那么单位就不能依据协议来主张违约金。
- 特殊情况：即使协议中没有约定违约金，但如果医生的行为给单位造成了实际损失，单位仍然有权要求医生赔偿损失。不过，这种赔偿是基于实际损失，而不是基于违约金的约定。
关于服务期和违约金的特殊规定（如适用）：
- 如果定向培养协议涉及到了服务期和违约金的特殊规定（如某些政府资助的定向培养项目），那么还需要根据这些特殊规定来判断。例如，有些项目可能规定医生在完成培养后必须在单位服务一定年限，如果提前离职则需要支付违约金。这种情况下，医生需要仔细阅读协议条款，了解自己的权利和义务。
- 法律依据：对于涉及政府资助的定向培养项目，可能还会有相关的行政法规或部门规章对服务期和违约金进行具体规定。医生在签订协议时应当仔细了解这些规定，并确保自己的权益不受侵害。
建议：
- 对于医生而言，在签订定向培养协议时，应当仔细阅读协议条款，特别是关于违约金和服务期的约定。如果有任何疑问或不明确的地方，应当及时向单位或相关部门咨询并寻求法律意见。
- 对于单位而言，在制定定向培养协议时，应当确保协议条款的合法性和合理性，避免因为违约金条款的无效或过高而引发纠纷。同时，单位也应当加强对医生的管理和培训，提高医生的职业素养和忠诚度，减少违约情况的发生。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。