关于您提出的“农村合作医疗报销完了起诉按总数还是按报销完的”这一问题，这主要涉及到医疗费用报销后的法律诉讼问题，特别是当涉及到赔偿或纠纷时，应以哪个金额作为诉讼的基数。
首先，我们需要明确的是，农村合作医疗（现已整合为城乡居民基本医疗保险）的报销是基于一定的政策规定和报销比例进行的。当您因医疗费用产生纠纷并考虑通过法律途径解决时，关键在于理解报销前后的费用性质以及法律诉讼的标的。
报销前的总费用：这是您因疾病或伤害而实际产生的全部医疗费用，包括药品费、检查费、治疗费等。这个金额是您最初需要承担的费用，也是医保报销的基数。
报销后的费用：在您按照医保政策进行报销后，实际需要您个人承担的费用会减少。报销后的费用可能包括自费部分、起付线以下部分以及报销比例之外的部分等。
在法律诉讼中，如果您是因为医疗费用问题而起诉，那么诉讼的标的（即您要求赔偿或争议的金额）通常应该是您实际遭受的损失，也就是报销前您需要承担的总费用中，因对方责任而应由对方承担的部分。然而，在实际操作中，如果医保已经报销了一部分费用，那么这部分费用通常不再作为诉讼的标的，因为您已经通过医保得到了补偿。
具体来说：
如果您是因为医疗事故或医疗纠纷而起诉医疗机构或相关责任方，那么您应该以报销前的总费用中，因对方责任而应由对方承担的部分作为诉讼标的。在诉讼过程中，您可以提供医保报销的相关证明，以说明您已经通过医保得到了部分补偿，但这并不影响您要求对方承担剩余部分的赔偿责任。
如果您是因为其他原因（如交通事故、工伤等）而起诉第三方责任方，并且该责任方需要承担您的医疗费用，那么同样地，您应该以报销前的总费用中应由对方承担的部分作为诉讼标的。在获得赔偿后，如果您已经通过医保报销了部分费用，那么这部分费用可能需要按照相关规定进行退还或处理（具体取决于当地的医保政策和法律规定）。
总结：在农村合作医疗报销后起诉时，您应以报销前的总费用中应由对方承担的部分作为诉讼标的，而不是报销后的费用。同时，在诉讼过程中，您需要提供相关的医保报销证明和费用明细等证据材料，以支持您的诉讼请求。希望这个解答能够帮助您更好地理解这个问题。