结论：在母亲杀害父亲的情况下，儿子作为亲属，在法律上并没有“认”或“不认”的直接权利或义务，这更多涉及个人情感和道德层面的选择。但从法律角度，儿子仍需面对一系列与案件相关的法律程序和后果。以下从多个角度进行分析：
一、法律程序与儿子的角色
报案与配合调查：
- 在发现犯罪行为后，任何公民都有义务向公安机关报案。儿子作为亲属，如果知晓犯罪事实，虽然法律上没有强制要求其必须报案，但从道德和社会责任角度，报案是合理的选择。
- 在案件调查过程中，儿子可能需要配合公安机关的调查，提供证言或其他相关证据。
作为证人的义务：
- 如果儿子目击了犯罪过程或了解相关情况，他可能被要求作为证人出庭作证。这是法律规定的公民义务，儿子应当履行。
二、法律后果与儿子的权益
继承权的影响：
- 根据《民法典》的相关规定，故意杀害被继承人的继承人将丧失继承权。因此，如果母亲被认定杀害父亲，她将丧失对父亲遗产的继承权。
- 儿子作为父亲的法定继承人之一，其继承权不受母亲犯罪行为的影响（除非儿子也参与了犯罪或存在其他丧失继承权的情形）。
刑事责任与儿子的关系：
- 母亲杀害父亲构成犯罪，将依法承担刑事责任。这一犯罪行为与儿子无关，儿子不会因母亲的犯罪行为而承担刑事责任。
- 但儿子可能会因母亲的犯罪行为而遭受情感上的伤害和困扰，这是法律无法直接干预的领域。
三、个人情感与道德层面的选择
情感上的接受与拒绝：
- 儿子在情感上可能难以接受母亲杀害父亲的事实，这是完全正常的反应。他有权选择如何处理这种情感上的困扰，包括寻求心理咨询或支持。
- “不认”母亲在情感上可能是一种自我保护的方式，但法律上并没有规定儿子必须与母亲断绝关系或采取其他特定行动。
道德层面的考量：
- 儿子在道德层面可能会面临诸多考量，如是否应该原谅母亲、是否应该继续与母亲保持联系等。这些决策应基于个人的价值观和道德观念，法律无法提供具体的指导。
四、建议与行动指南
寻求法律援助：
- 如果儿子在案件处理过程中遇到法律问题或需要法律帮助，可以寻求专业律师的协助。作为专注于刑事辩护和合同纠纷的律师，我可以为儿子提供相关的法律咨询和帮助。
关注个人心理健康：
- 面对如此重大的家庭变故，儿子应关注自己的心理健康，必要时寻求心理咨询或支持。这有助于他更好地处理情感上的困扰和压力。
了解法律程序与权益：
- 儿子应了解与案件相关的法律程序和自己的权益，以便在必要时采取适当的行动保护自己的合法权益。
总结：在母亲杀害父亲的情况下，儿子在法律上并没有“认”或“不认”的直接权利或义务。他应关注法律程序、保护自己的合法权益，并寻求必要的法律和心理支持。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。