事业单位工作人员能否续签耕地协议，需分情况讨论，核心取决于其身份是否影响协议合法性及当地政策规定，具体分析如下：

1. 若事业单位工作人员以普通民事主体身份签订耕地协议
   若其签订耕地协议的行为与职务无关（例如以个人名义承包村集体耕地用于农业种植），且协议内容符合《民法典》中关于农村土地承包合同的规定（如双方自愿、内容合法、未违反土地管理法规等），则可以依法续签。此时其事业单位工作人员的身份不影响协议效力，续签需满足原协议约定的条件（如承包期限届满、双方协商一致等）。

2. 若事业单位工作人员以职务身份签订或协议涉及公权力行使

   • 若其代表事业单位签订耕地相关协议（如单位需使用耕地进行公共项目建设），则需根据《土地管理法》《农村土地承包法》等规定，履行审批、征收等法定程序。此类协议续签需以单位名义进行，且需符合公共利益需求，个人无权单独决定续签。
     
   • 若协议涉及利益冲突（如工作人员利用职务便利为自己或亲属谋取耕地承包权），则可能违反《公务员法》《事业单位工作人员处分暂行规定》中关于“廉洁纪律”的规定，此时协议可能被认定无效，无法续签。

3. 地方政策对耕地协议续签的特殊限制
   部分地区可能出台政策对耕地承包、流转进行额外限制（如限制非农主体承包、要求优先承包给本村集体成员等）。若事业单位工作人员不符合当地政策要求（如非本村集体成员且无特殊许可），则可能无法续签协议。

建议：续签前需核实原协议性质（个人行为还是职务行为）、当地政策要求，并确保协议内容合法合规。若涉及职务行为或复杂法律关系，可进一步向我咨询具体操作流程及风险防范。