在民事案件中，若借款协议的认定事实错误或适用法律错误，可能会承担以下后果：
案件被改判或发回重审：
- 事实认定错误：如果法院在审理借款协议纠纷时，对关键事实的认定存在错误，比如错误地认定了借款金额、借款时间、还款情况等，那么根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，上级法院在二审或再审中，可能会撤销原判决，并根据正确的事实重新作出判决，或者将案件发回原审法院重新审理。
- 法律适用错误：如果法院在审理过程中，错误地适用了法律条款，比如将无效的借款协议认定为有效，或者将有效的借款协议认定为无效，那么上级法院在二审或再审中，同样可能会撤销原判决，并根据正确的法律条款重新作出判决。
承担诉讼费用及可能的其他费用：
- 如果因为事实认定错误或法律适用错误导致案件被改判或发回重审，那么原判决中确定的诉讼费用分担可能会发生变化。通常，败诉方需要承担诉讼费用，但如果因为法院的错误导致败诉方原本不应承担的费用被错误地判决承担，那么这部分费用可能会在改判或发回重审后得到调整。
- 此外，如果因为案件被发回重审或改判导致当事人产生了额外的费用，如律师费、差旅费等，这些费用虽然不一定能得到全额赔偿，但在某些情况下，法院可能会根据公平原则，酌情判决由过错方承担部分或全部费用。
影响当事人的信用记录：
- 如果借款协议纠纷涉及到金融机构或第三方信用机构，那么法院的判决结果可能会被这些机构记录在当事人的信用记录中。如果因为事实认定错误或法律适用错误导致当事人被错误地判决承担还款责任，那么这可能会对当事人的信用记录产生负面影响，进而影响其未来的借贷、消费等行为。
可能引发其他法律纠纷：
- 如果借款协议纠纷的处理结果因为事实认定错误或法律适用错误而引发了新的争议或纠纷，比如当事人对改判或发回重审的结果不服而提起上诉或申请再审，或者因为错误判决导致当事人与其他第三方产生了新的法律关系或纠纷，那么这可能会进一步增加当事人的法律成本和风险。
针对以上后果，我给出以下建议：
- 在签订借款协议时，务必确保协议内容真实、准确、完整：避免因为协议内容存在歧义或错误而导致后续纠纷。
- 在发生借款协议纠纷时，及时收集并保存相关证据：以便在诉讼过程中能够充分证明自己的主张和事实。
- 在诉讼过程中，积极配合法院的审理工作：如实陈述事实、提供证据，并尊重法院的判决结果。如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。
如果您在借款协议纠纷中遇到了认定事实错误或适用法律错误的情况，或者有任何其他法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议和帮助。