总包单位是可以往农民工工资专户转账的，这一做法不仅符合法律规定，而且是保障农民工工资支付、减少拖欠现象的有效措施。以下是对此问题的详细解答：
法律依据
根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，特别指出了在工程建设领域推行分包单位农民工工资委托施工总承包单位代发制度。这意味着，总包单位在特定情况下，有责任和义务代发农民工工资，且这一过程需要通过农民工工资专用账户进行。
操作流程
设立专用账户：总包单位需在工程项目所在地银行开设“农民工工资专用账户”，此账户专款专用，仅用于支付该项目农民工的工资，确保资金的安全与合规性。
分包单位提交工资支付表：分包单位需按月考核农民工的工作量，并编制工资支付表，该表需包含农民工的姓名、身份证号、工作天数、应发工资等详细信息，并经农民工本人签字确认。之后，分包单位将这份工资支付表连同当月工程进度情况一并提交给总包单位。
总包单位审核与代发：总包单位对分包单位提交的工资支付表进行审核，确认无误后，通过农民工工资专用账户将工资直接支付到农民工本人的银行账户。这一过程中，总包单位需确保账户资金充足，以按时足额支付工资。
责任界定
总包单位责任：总包单位对所承包工程项目的农民工工资支付负总责，需监督分包单位按时足额提供工资支付信息，并确保农民工工资专用账户资金充足，及时、足额代发工资。若分包单位拖欠农民工工资，总包单位需先行清偿，并有权依法进行追偿。
分包单位责任：分包单位则负责准确核算农民工的工作量和工资，确保提供的工资支付表真实、完整，并对所招用农民工的实名制管理和工资支付负直接责任。
意义与影响
这一制度对农民工而言，显著减少了工资发放的中间环节，降低了被拖欠工资的风险，确保了农民工能够及时、足额收到工资，从而保障了其基本生活和合法权益。对建筑行业而言，则有助于规范建筑市场秩序，减少因工资纠纷引发的社会不稳定因素，提升建筑行业的整体形象和信誉，促进建筑行业的健康、可持续发展。
综上所述，总包单位往农民工工资专户转账是符合法律法规且行之有效的措施，对于保障农民工权益、维护社会稳定以及推动建筑行业健康发展具有十分重要的作用。