结论概述：市场监管总局在查处直播电商案件中，通过强化分层分级监管、跨区域指挥调度及穿透式监管等措施，实施穿透式监管并保障程序合法。这些措施旨在应对直播电商行业人、货、场分离、交易链条长、法律关系复杂等挑战，确保监管工作的有效性和合法性。以下结合新闻背景，从穿透式监管的实施方式、程序合法保障及法律后果等角度进行详细分析。
一、穿透式监管的实施方式
分层分级监管：
- 实施背景：直播电商平台跨域跨界经营，法律关系复杂，给监管带来挑战。
- 具体措施：市场监管部门合理划分平台监管职责，统筹运用提级管辖、指定管辖等机制，加大监管执法力度。例如，总局将坚决依法查处具有全国影响的直播电商重大案件，支持省级市场监管部门积极主动作为，形成治理合力。
跨区域指挥调度：
- 实施背景：直播电商行业人、货、场分离，交易链条长，涉及区域广。
- 具体措施：总局加强对跨区域重大案件的指挥调度，强化信息共享和协同配合，建立健全“线上发现、线下追查，线下发现、线上管控”的一体化监管机制，推动全链条打击，实现源头治理。
穿透式监管试点：
- 实施背景：直播电商参与主体法律关系复杂，需创新监管模式。
- 具体措施：指导平台经济活跃地区市场监管部门开展穿透式监管试点，加强对主体、客体和行为的监测监管和穿透分析，实现对关联违法主体的一并追查，对重点风险商品的溯源管理，对关联违法行为的系统查处。
二、程序合法保障
依法查处：
- 法律依据：市场监管部门在查处直播电商案件时，必须严格依照《中华人民共和国电子商务法》、《中华人民共和国消费者权益保护法》、《中华人民共和国广告法》等相关法律法规进行，确保程序合法。
- 具体做法：在查处过程中，市场监管部门需遵循法定程序，如立案、调查取证、审查决定、告知听证、执行等，确保每一步都符合法律规定。
公正透明：
- 实施原则：市场监管部门在实施穿透式监管时，应坚持公正、透明原则，确保监管行为的公正性和透明度。
- 具体做法：通过公开监管信息、接受社会监督等方式，增强监管的公信力和权威性。例如，市场监管总局召开直播电商监管专题新闻发布会，公开监管政策和措施，接受社会监督。
权利保障：
- 实施重点：在穿透式监管过程中，市场监管部门应充分保障当事人的合法权益，如知情权、陈述申辩权、听证权等。
- 具体做法：在查处案件时，市场监管部门需告知当事人相关权利，并为其提供陈述申辩和听证的机会，确保当事人的合法权益不受侵害。
三、法律后果及行业警示
法律后果：
- 对违法主体的处罚：对于违反相关法律法规的直播电商主体，市场监管部门将依法给予行政处罚，如罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。情节严重的，还可能面临刑事责任。
- 对行业的警示：市场监管总局的严厉监管和查处行动，将对直播电商行业产生强烈的警示作用，促使行业主体自觉遵守法律法规，规范经营行为。
行业规范发展：
- 推动行业自律：市场监管部门通过穿透式监管，可以推动直播电商行业建立自律机制，加强行业内部管理，提高行业整体素质和竞争力。
- 促进健康发展：通过加强监管和查处违法行为，可以净化直播电商市场环境，保护消费者权益，促进直播电商行业的健康、可持续发展。
进一步思考与建议：对于直播电商行业主体而言，应密切关注市场监管部门的监管政策和措施，加强内部管理，规范经营行为，确保合法合规经营。同时，消费者也应提高警惕，增强自我保护意识，避免在直播电商交易中遭受损失。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。