劳务外包单位发的加班工资，本单位（发包方）一般不需要扣管理费用，但具体是否需要扣除管理费用，需根据劳务外包合同的约定以及实际用工管理情况来确定。以下是对此问题的详细分析：
合同约定是关键：
- 劳务外包合同中关于加班工资支付及管理费用扣除的条款是判断支付责任的关键。如果合同明确约定由发包方或承包方（劳务外包单位）承担加班工资支付责任，并且约定了管理费用的扣除方式，那么相应的一方就应当按照约定执行。
- 若合同中没有明确约定管理费用的扣除，那么发包方通常没有权利单方面扣除劳务外包单位支付给劳动者的加班工资作为管理费用。
实际用工管理情况：
- 在实际劳务外包作业中，如果发包方对劳动者进行具体的工作指挥和监督，且劳动者的加班是基于发包方的要求和指令，那么从事实劳动关系角度考虑，发包方可能需要承担一定的管理责任，但这并不意味着发包方可以扣除加班工资作为管理费用。管理责任的承担与加班工资的扣除是两个不同的法律概念。
- 如果承包方拥有独立的用工管理权限，并自行安排劳动者加班以完成承包任务，那么承包方应按照相关法律规定向劳动者支付加班工资，发包方通常不承担加班工资的支付责任，也无权扣除管理费用。
法律原则与规定：
- 根据我国《劳动法》及相关规定，用人单位（在此情境下更贴近于劳务外包单位，即承包方）安排劳动者延长工作时间的，应支付相应的加班费。这一规定主要适用于劳动关系中的用人单位和劳动者，而劳务外包关系中，由于不存在直接的劳动关系（发包方与劳动者之间），因此加班费的支付并不直接受《劳动法》对发包方的约束，但劳务外包单位作为实际用工方需遵守。
- 管理费用的扣除通常需要在合同中有明确约定，且不得违反法律法规的强制性规定。如果发包方试图单方面扣除加班工资作为管理费用，可能涉嫌违法，劳动者或劳务外包单位有权提出异议并寻求法律救济。
建议：
- 为了避免潜在的纠纷和争议，建议劳务外包公司和用工单位在签订合同时明确约定加班工资的支付条件、标准和方式，以及管理费用的扣除方式（如有）等相关条款。
- 如果双方对合同条款存在争议或不明确的地方，应及时协商补充或修改合同，以确保双方权益得到保障。
- 在实际操作中，双方应严格遵守合同约定和相关法律法规的规定，确保所有操作都合法合规。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。