若公司预支款项后员工不还款，公司可通过内部制度处理、协商、调解、仲裁或诉讼等途径解决。以下是详细分析：

1. 内部制度处理：

   • 依据公司规章制度：首先，公司应检查内部是否有关于预支款项及还款的相关规章制度。如果员工在预支时签署了相关协议或承诺书，明确了还款期限和方式，那么公司可以依据这些内部规定，对不还款的员工进行相应的处理，如扣除工资、奖金等（但需确保处理方式符合劳动法规定，不侵犯员工合法权益）。
   • 发送催款通知：公司可以通过书面或电子邮件形式向员工发送催款通知，明确还款金额、期限及逾期不还的后果，给予员工合理的还款时间。

2. 协商与调解：

   • 双方协商：在内部制度处理无果或情况较为复杂时，公司可以尝试与员工进行协商，了解其不还款的具体原因，并寻求双方都能接受的解决方案。
   • 第三方调解：如果协商不成，公司可以考虑邀请第三方（如劳动争议调解委员会）进行调解，以促成双方达成和解协议。

3. 法律途径：

   • 劳动仲裁：如果员工拒绝还款且协商、调解均无果，公司可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求员工归还预支款项。在申请仲裁时，公司需要提供充分的证据，如预支协议、催款通知、员工工资记录等。
   • 民事诉讼：如果劳动仲裁结果对公司不利或员工不履行仲裁裁决，公司还可以向人民法院提起民事诉讼，要求员工归还预支款项及可能产生的利息、违约金等。在诉讼过程中，公司同样需要提供充分的证据来支持其主张。

额外建议：

• 完善预支制度：为避免类似情况再次发生，公司应完善预支款项的制度，明确预支条件、金额、期限及还款方式等，并要求员工在预支时签署相关协议或承诺书。
• 加强财务管理：公司应加强财务管理，对预支款项进行严格监控和管理，确保款项的合理使用和及时归还。
• 法律培训：定期对员工进行法律培训，提高员工的法律意识，使其了解预支款项的法律后果和责任。