补充协议在以下情形下会被认定为无效：

1. 主体不适格：

   • 无民事行为能力人签订：根据《中华人民共和国民法典》，不满八周岁的未成年人、不能辨认自己行为的八周岁以上的未成年人及成年人，均属于无民事行为能力人。他们签订的补充协议无效，需由其法定代理人代理实施民事法律行为。例如，一个7岁的孩子未经家长同意，自行签订的补充协议是无效的。
   • 限制民事行为能力人签订且未获追认：八周岁以上的未成年人和不能完全辨认自己行为的成年人，为限制民事行为能力人。他们签订的补充协议，若不属于纯获利益或与其年龄、智力等相适应的情形，且未经法定代理人同意或追认，则协议无效。比如，一个15岁的孩子未经家长同意，签订了一份涉及较大金额的补充协议，且该协议并非纯获利益，那么这份协议在未获家长追认的情况下是无效的。
   • 代理人无权代理或超越代理权：如果代理人在没有代理权、超越代理权或者代理权终止后仍然以被代理人名义签订补充协议，且未经被代理人追认的，那么该补充协议将被认定为无效。例如，员工未经公司授权，擅自以公司名义签订的补充协议，若公司未予追认，则该协议无效。

2. 意思表示不真实：

   • 欺诈与胁迫：若一方以欺诈或胁迫手段使对方违背真实意思签订补充协议，受欺诈或胁迫方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议，撤销后协议自始无效。比如，一方通过虚构事实或隐瞒真相的方式，使对方在不知情的情况下签订了补充协议，或者一方以威胁、恐吓等手段迫使对方签订补充协议，这些情况下签订的协议都是无效的。
   • 重大误解：基于重大误解签订的补充协议，行为人有权请求法院或仲裁机构撤销。一旦撤销，协议即失去效力。例如，双方对协议中的关键条款存在重大误解，导致协议内容与双方真实意愿不符，那么这份协议在撤销后是无效的。

3. 内容违法违规或违背公序良俗：

   • 违反法律、行政法规的强制性规定：补充协议的内容若违反法律、行政法规的强制性规定，则该协议无效。但需注意，某些强制性规定可能不影响协议的效力。比如，双方约定进行非法交易或侵犯他人合法权益的补充协议，就是无效的。
   • 违背公序良俗：补充协议的内容若违背公共秩序与善良风俗，即社会普遍认可的道德和正常秩序，该协议同样无效。例如，双方约定将房屋用于非法活动或进行其他违背公序良俗的行为的补充协议，就是无效的。

4. 损害第三人和社会公共利益：

   • 补充协议的内容若损害第三人的合法权益或社会公共利益，该协议将被视为无效。这体现了法律对公平、正义原则的保护。比如，双方通过签订补充协议来逃避债务或转移资产，从而损害债权人的利益，这样的协议就是无效的。

5. 形式要件缺失：

   • 补充协议作为合同的一部分，需要双方当事人的签字确认才能生效。如果补充协议未经双方签字或盖章，或者存在其他形式上的瑕疵，如未采用书面形式等（对于法律、行政法规规定必须采用书面形式的合同而言），那么它将被视为无效。不过，对于一般性的补充协议，法律并未强制要求必须采用书面形式，口头形式或其他能够证明协议存在的形式也可能有效。

6. 主合同无效：

   • 补充协议是对主合同的补充和细化，其效力依附于主合同。因此，如果主合同本身无效，那么基于该主合同签订的补充协议也原则上无效。比如，主合同因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效，那么基于该主合同签订的补充协议也是无效的。

建议：为了避免补充协议无效的情形，双方当事人在签订补充协议时应当确保协议内容真实、合法，并明确双方的权利和义务。同时，应充分了解协议内容，并在自愿、平等的基础上达成协议。如果协议内容存在争议或不明确的地方，应当及时沟通并协商解决，以确保协议的合法性和有效性。如果您在签订补充协议过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。