结论前置：公证强制执行的案件中，若借款合同存在法定无效情形，仍然可以被确认无效。

一、公证的性质与局限性

公证是公证机构根据申请，对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性进行证明的活动。在借款合同中，公证主要起到证明合同签订过程真实、合法的作用，并赋予合同强制执行效力（在符合法定条件时）。然而，公证并不能确保合同在所有情况下的绝对有效性。公证机构在进行公证时，主要进行形式审查和有限的实质审查，可能无法完全发现合同存在的无效情形。

二、借款合同无效的法定情形

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款合同无效的情形主要包括以下几种：

1. 无民事行为能力人签订的合同：如不满八周岁的未成年人或不能辨认自己行为的成年人所签订的借款合同，即使经过公证也无效。
2. 虚假意思表示或欺诈、胁迫手段订立的合同：包括行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为，以及一方以欺诈、胁迫手段订立且损害国家利益的借款合同，均属无效。
3. 违反法律、行政法规的强制性规定的合同：若借款合同内容违反法律、行政法规的强制性规定（且该规定导致合同无效），则合同无效。例如，未取得合法金融业务资质而从事放贷业务的借款合同。
4. 违背公序良俗或损害社会公共利益的合同：借款合同内容若违背公序良俗或损害社会公共利益，如高利贷合同（超出法定利率上限部分），即使经过公证也应被认定无效。
5. 恶意串通，损害他人合法权益的合同：行为人与相对人恶意串通，损害国家、集体或第三人合法权益的借款合同，同样属于无效合同。

三、公证强制执行与合同无效的关系

公证强制执行是公证机构根据当事人的申请，对具有给付内容的债权文书赋予强制执行效力的一种公证活动。当借款合同被公证赋予强制执行效力后，若债务人不履行或履行不适当，债权人可以不经诉讼程序，直接向有管辖权的人民法院申请强制执行。然而，公证强制执行并不影响借款合同本身的效力判断。如果借款合同存在上述无效情形，即使已经过公证并赋予强制执行效力，人民法院或仲裁机构仍可以依法确认合同无效，并据此作出相应的裁决。

四、法律建议

1. 签订合同时谨慎审查：在签订借款合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同内容真实、合法、有效。避免出现可能导致合同无效的情形，如欺诈、胁迫、恶意串通等。
2. 寻求专业法律意见：在必要时寻求专业法律意见，以确保合同的合法性和有效性。律师可以对合同条款进行审查，并提供法律建议和风险评估。
3. 争议解决途径：如对借款合同效力存在争议，可通过向人民法院提起诉讼或申请仲裁等方式，由法院或仲裁机构对合同的效力进行审查和判定。在诉讼或仲裁过程中，当事人应提供充分的证据证明合同存在无效情形。

综上所述，公证强制执行的案件中，若借款合同存在法定无效情形，仍然可以被确认无效。当事人在签订和履行借款合同时应严格遵守法律法规，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。