您好，关于您提出的“应届大学生实习生签三方协议实习6个月后是否就可以自由了”的问题，这其实涉及到实习期与试用期、以及劳动关系建立等多个法律概念，下面我将为您详细解答。

首先，需要明确的是，实习期并不等同于试用期。实习期是在校大学生为了积累工作经验、提高实践能力和专业技能而参加社会实践工作的时期，在此期间，您与用人单位之间并未建立正式的劳动关系。而试用期则是员工正式加入公司后，公司评估其是否符合岗位要求的过渡期，试用期需要明确约定，并且包含在劳动合同期限内。

接下来，针对您的情况，如果您在实习6个月后继续留在公司工作，并且已经拿到了毕业证书，那么此时您与公司的关系就发生了变化。根据相关法律规定，一旦您毕业并继续在公司工作，双方之间就实际建立了劳动关系。这意味着，公司不能再将您视为实习生，而应该按照正式员工来对待。

然而，建立劳动关系并不意味着您就“自由”了，或者说可以随意离职。实际上，此时您与公司之间应该签订正式的劳动合同，明确双方的权利和义务。如果公司未与您签订劳动合同，或者您想要离职，都需要按照法律规定的程序来进行。例如，如果您想要离职，通常需要提前通知公司，并按照公司规定的流程办理离职手续。

另外，关于试用期的问题，如果公司在您实习期满后继续留用您，并且想要设定试用期，那么必须明确约定试用期的期限和工资等条件，并且这些条件需要符合法律的规定。试用期的期限并不是由公司随意决定的，而是根据劳动合同的期限来确定的。同时，试用期的工资也不得低于本单位相同岗位最低档工资的80%或者不得低于劳动合同约定工资的80%，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。

最后，我想强调的是，无论是实习期还是试用期，您都应该了解自己的权益和义务，并且按照法律规定的程序来行事。如果您在实习或工作过程中遇到任何问题或纠纷，都可以寻求法律帮助或咨询专业人士的意见。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。