您好，针对您提出的“中职自主学习是否需要三方协议”以及“不交三方协议学校不给毕业证怎么办”这两个问题，我将结合您提供的参考信息，为您进行详细解答。
首先，关于中职自主学习是否需要三方协议的问题。
中职自主学习本身并不直接要求签订三方协议。三方协议，即《普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书》，主要是针对高校毕业生在就业过程中，与学校、用人单位三方共同签订的，用于明确各方在毕业生就业过程中的权利和义务的协议。而中职学生的自主学习，更多关注的是学生个人技能的提升和学习成果的获取，并不直接涉及就业问题，因此并不需要签订三方协议。
接下来，关于不交三方协议学校不给毕业证怎么办的问题。
学校以不交三方协议为由扣发毕业证的做法是不合理的，也是不合法的。根据相关法律法规和教育部的要求，学校不得将毕业证书的发放与签订三方协议等就业相关事项挂钩。毕业证书是学生在学校完成规定学业后，由学校颁发的证明其学业成绩和学历层次的凭证，与学生的就业情况无关。
如果您遇到学校以不交三方协议为由扣发毕业证的情况，您可以采取以下措施来维护自己的权益：
与学校沟通：首先，您可以尝试与学校的相关部门或负责人进行沟通，明确表达自己的立场和诉求，要求学校按照法律法规和教育部的要求，及时发放毕业证书。
寻求帮助：如果与学校沟通无果，您可以向当地的教育行政部门或相关监管机构进行投诉和举报，寻求他们的帮助和支持。
法律途径：在必要时，您还可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起诉讼等。
同时，我也想提醒您，虽然三方协议不是中职学生必须签订的，但如果您在自主学习过程中有实习或就业的打算，签订一份规范的三方协议也是有益的。它可以帮助您明确与用人单位之间的权利和义务，保障您的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。