自然人跟企业合伙股东，股东要撤股，主要需遵循以下手续和步骤：
一、明确撤股原因与性质
首先，需要明确股东撤股的原因和性质。撤股可能因多种原因，如股东个人资金需求、对公司经营策略的不满、股东间的矛盾等。撤股的性质也需明确，是股权转让、公司回购还是其他方式。不同的撤股原因和性质，将影响后续的手续和流程。
二、股权转让方式撤股
如果股东选择通过股权转让的方式撤股，那么需要遵循以下步骤：
寻找受让方：股东需要寻找合适的受让方，可以是公司内部的其他股东，也可以是外部的投资者。
签订股权转让协议：股东与受让方需要签订股权转让协议，明确股权转让的价格、支付方式、转让时间等关键条款。
公司内部审批：根据公司的章程和相关法律法规，股权转让可能需要经过公司董事会或股东会的审批。
工商变更登记：股权转让完成后，需要到工商行政管理部门办理股权变更登记手续，更新公司的股东名册和工商登记信息。
三、公司回购方式撤股
如果股东选择通过公司回购的方式撤股，那么需要遵循以下步骤：
公司内部决策：公司需要召开董事会或股东会，就回购事宜进行决策，并形成决议。
签订回购协议：公司与撤股股东需要签订回购协议，明确回购的价格、支付方式、回购时间等关键条款。
支付回购款项：公司需要按照回购协议的约定，向撤股股东支付回购款项。
工商变更登记：回购完成后，同样需要到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。
四、注意事项
遵守法律法规：在撤股过程中，必须严格遵守《公司法》、《合同法》等相关法律法规的规定，确保撤股的合法性和有效性。
保护其他股东权益：撤股过程中，应充分考虑其他股东的权益，避免因撤股而损害其他股东的利益。例如，在股权转让时，应确保其他股东享有优先购买权。
完善公司章程：公司章程是公司治理的重要依据，应在公司章程中明确股东撤股的相关条款和程序，以便在撤股时有所依据。
税务处理：撤股可能涉及税务问题，如股权转让所得的个人所得税等。股东在撤股前应咨询税务部门或专业税务顾问，了解相关税务政策和规定。
总结来说，自然人跟企业合伙股东撤股，主要可以通过股权转让或公司回购的方式实现。在撤股过程中，应明确撤股原因与性质，遵守相关法律法规和公司章程的规定，保护其他股东权益，并妥善处理税务问题。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。