公司经理违规报销的处理需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若违规行为尚未造成实际损失或情节轻微

   • 内部处理：公司可依据《劳动合同法》及内部规章制度（如《员工手册》《财务报销制度》），对经理进行警告、记过、降薪或解除劳动合同等处分。需注意：
     
     • 规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则可能被认定为无效；
       
     • 处理程序需合法（如提前告知经理违规事实、听取其申辩、出具书面处分决定）。
       
   • 要求退赔：若经理已实际获得报销款项，公司可要求其返还，并可通过工资扣减（需符合《工资支付暂行规定》中“每月扣减不超过工资20%”的限制）或民事诉讼追偿。

2. 若违规行为涉嫌职务侵占或贪污（数额较大或情节严重）

   • 刑事报案：根据《刑法》第271条，职务侵占罪（利用职务便利侵占公司财物，数额达6万元以上）或贪污罪（若经理具有国家工作人员身份），公司可向公安机关报案，追究其刑事责任。
     
   • 民事赔偿：在刑事程序外，公司仍可单独提起民事诉讼，要求经理赔偿全部损失（包括直接损失及利息、维权成本等）。

3. 若公司制度存在漏洞或管理失职

   • 完善制度：需修订报销流程（如增加审批层级、要求提供原始凭证、引入电子审批系统），明确违规责任条款。
     
   • 追责管理层：若其他管理人员对违规行为存在纵容或失察，公司可依据内部规定对其连带问责，避免“只罚基层、不罚高层”的公平性质疑。

实务建议：

• 处理前需固定证据（如报销单据、审批记录、经理承认违规的书面或录音证据）；
  
• 避免“以罚代管”，需通过培训、审计等方式预防再次发生；
  
• 若涉及高管，需平衡处理力度与公司声誉，必要时可协商离职（如签署《离职协议》明确放弃追偿权）。
  

如有具体情节（如违规金额、是否伪造单据、是否涉及利益输送等），可进一步向我咨询，我会结合案例提供更精准的方案。