合同由公司工商登记总经理签字，其法律效力需分情况讨论，具体如下：

1. 总经理为法定代表人时：

   • 法律效力：若总经理同时是公司的法定代表人，根据《民法典》的相关规定，其以法人名义从事的民事活动，法律后果由法人承受。因此，总经理作为法定代表人在合同上的签字，即代表公司，合同在合法内容下成立并生效（前提是无其他无效情形，如意思表示不真实、违反法律法规强制性规定等）。
   • 法律依据：《民法典》第六十一条规定，依照法律或者法人章程的规定，代表法人从事民事活动的负责人，为法人的法定代表人。法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。

2. 总经理非法定代表人但获授权时：

   • 法律效力：若总经理并非法定代表人，但其签字行为得到了公司的明确授权（如公司章程、股东会决议、董事会决议或授权委托书等），则在授权范围内，其签字同样具有法律效力。这要求公司有明确的授权文件或惯例，表明总经理有签署此类合同的权限。
   • 法律依据：《民法典》第一百六十二条规定，代理人在代理权限内，以被代理人名义实施的民事法律行为，对被代理人发生效力。

3. 总经理无权代理或超越代理权时：

   • 法律效力：若总经理未经授权或超越授权范围签字，该行为可能构成无权代理或超越代理权。此时，除非公司事后追认，否则对公司不发生效力，责任可能由总经理个人承担。
   • 法律后果：根据《民法典》第一百七十一条规定，行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。相对人可以催告被代理人自收到通知之日起三十日内予以追认。被代理人未作表示的，视为拒绝追认。行为人实施的行为被追认前，善意相对人有撤销的权利。撤销应当以通知的方式作出。行为人实施的行为未被追认的，善意相对人有权请求行为人履行债务或者就其受到的损害请求行为人赔偿。但是，赔偿的范围不得超过被代理人追认时相对人所能获得的利益。相对人知道或者应当知道行为人无权代理的，相对人和行为人按照各自的过错承担责任。

4. 合同特定生效条件未满足时：

   • 法律效力：如合同明确约定必须加盖公司公章才生效，而仅有总经理签字未盖章，则合同可能因未满足生效条件而无效。
   • 实践建议：为避免此类纠纷，公司应在合同中明确约定生效条件，如“本合同自双方签字并盖章之日起生效”。

实践中的建议与注意事项：

• 明确授权：公司在授权总经理签字时，应明确授权范围和期限，并出具书面授权文件，以减少法律纠纷风险。
• 审查合同：总经理在签字前，应仔细审查合同内容，确保合法性、合规性及符合公司利益。
• 保留证据：公司应妥善保管授权文件、合同原件等证据材料，以备不时之需。

总结：合同由公司工商登记总经理签字是否有效，主要取决于总经理的法定身份、签字行为是否获得授权、合同内容的合法性以及是否满足合同生效的其他特定条件。在一般情况下，如果总经理是法定代表人或获得了公司的明确授权，并且合同内容合法、满足生效条件，那么其签字是具有法律效力的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。