合同没有总经理签字只有公章，在大多数情况下仍然是有效的，但具体效力需结合合同内容、双方当事人的真实意思以及法律或双方的特别约定来综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

法律依据与合同效力判断

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，签字、盖章或按指印都是合同成立的有效方式，并非必须同时具备。公章作为法人或非法人组织的象征，加盖公章通常代表法人或非法人组织的意志。因此，在合同上加盖公章，即使没有总经理签字，也通常能够认定合同的有效性。

合同效力的具体情形

1. 有效情况：

   • 合同无特殊约定：如果合同中没有特别约定必须同时加盖公章和总经理签字才生效，那么仅有公章而缺少总经理签字的合同，在合同内容合法、双方当事人具备缔约能力且意思表示真实的情况下，仍然有效。
   • 实际履行证明：即使合同未明确约定生效条件，但如果有其他证据能证明双方当事人同意合同内容并已实际履行，该合同也被视为有效。实际履行行为可以作为双方合意的补充证明。

2. 可能无效或存在争议情况：

   • 合同约定必须签字并盖章：如果合同明确约定必须同时签字并加盖公章才生效，而仅有公章没有总经理签字，那么合同可能因未满足生效条件而不生效。但这种情况较为少见，且需根据具体合同条款来判断。
   • 公章使用瑕疵：如果公章的使用存在瑕疵，如公章系伪造、被盗用或超越权限使用等，且相对人知道或应当知道该瑕疵的，那么加盖该公章的合同可能无效或效力待定。

实际操作建议

1. 明确合同生效条件：在签订合同时，建议双方明确约定合同的生效条件，以避免不必要的纠纷。如果合同对生效条件有特别约定，应严格按照约定执行。
2. 确保公章使用合法：法人或非法人组织应建立健全公章管理制度，确保公章的使用合法、合规。避免公章被盗用、伪造或超越权限使用等情况的发生。
3. 保留相关证据：在合同履行过程中，建议双方保留好与合同相关的证据，如履行凭证、沟通记录等。这些证据在发生纠纷时可以作为证明合同效力及双方权利义务的重要依据。

举例说明：假设一家公司与另一家公司签订了一份货物采购合同，合同上仅加盖了采购方的公章而没有总经理签字。如果合同中没有特别约定必须同时签字并加盖公章才生效，且双方均具备缔约能力、意思表示真实且合同内容合法，那么该合同仍然有效。双方应按照合同约定履行各自的义务。

总之，合同没有总经理签字只有公章在大多数情况下仍然是有效的，但具体效力需结合合同内容、双方当事人的真实意思以及法律或双方的特别约定来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。