针对您提出的“网上签完三方后学校纸质版还需要公司盖章吗”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确三方协议的基本性质和作用。三方协议，即《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是明确毕业生、用人单位、毕业生所在学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面协议。它不仅是毕业生与用人单位建立就业关系的正式凭证，也是毕业生毕业后到人事、教育等部门办理就业报到手续的必备材料之一。

接下来，我们分析网上签约与纸质版协议的关系。在数字化时代，网上签约已经成为一种便捷、高效的签约方式。毕业生和用人单位可以通过线上平台完成签约流程，生成电子协议书。然而，这并不意味着纸质版协议就失去了其存在的意义。纸质版协议作为三方协议的实体形式，仍然具有法律效力，并且在某些情况下可能是必需的。

针对您的问题，网上签完三方后，学校纸质版是否还需要公司盖章，这主要取决于学校的具体要求和流程。一般来说，即使已经完成了网上签约，学校可能仍然需要纸质版协议作为备案或存档的依据。在这种情况下，学生需要将下载打印的纸质版协议书交至用人单位进行盖章，然后再将盖章后的协议书交回学校进行最终审核和盖章。

具体来说，流程可能如下：

1. 毕业生与用人单位在网上完成签约流程，生成电子协议书。
2. 毕业生下载打印纸质版协议书（一式三份），交至用人单位进行盖章。
3. 用人单位在协议书上盖章后，毕业生将其中一份交回学校进行最终审核和盖章。
4. 学校对签约信息进行确认后，将网签数据同步至毕业生的就业方案，至此整个签约流程结束。

因此，网上签完三方后，学校纸质版协议书通常仍然需要公司盖章，以确保协议的完整性和法律效力。不过，具体流程可能因学校而异，建议您咨询所在学校的就业指导中心或相关部门，以获取最准确的信息和指导。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。