结论前置：入股未进行工商备案，在股东身份认定和股权行使上可能存在一定风险，但并不意味着入股行为完全无效。在公司发生债务时，未备案股东仍可能需承担相应责任，具体需结合实际情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、入股未工商备案的法律效力
股东身份认定：
- 工商备案的作用：工商备案是股东身份公示的重要方式，有助于保护交易安全，维护公司、股东和债权人的合法权益。未进行工商备案，可能影响股东身份的外部公示效力，使得第三人难以知晓股东的真实身份。
- 内部效力：尽管未进行工商备案，但如果股东已经实际出资，并参与了公司的经营管理，且其他股东均认可其股东身份，那么该股东在公司内部仍可能被视为合法股东。
股权行使：
- 权利受限：未进行工商备案的股东，在行使股权时可能面临一定障碍。例如，在转让股权时，可能因未备案而难以找到合适的受让人，或者受让人因担心股权瑕疵而拒绝受让。
- 风险承担：未备案股东在享受股权收益的同时，也需承担相应的风险。如果公司发生债务纠纷，未备案股东可能因身份不明而被排除在债务承担之外，但也可能因实际参与了公司经营而被认定为需承担责任的主体。
二、公司发生债务时未备案股东的责任
一般原则：
- 有限责任：根据公司法原理，股东以其出资额为限对公司承担有限责任。这意味着，无论股东是否进行工商备案，其对公司债务的承担均以其出资额为限。
- 例外情况：如果股东存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，那么该股东可能需对公司债务承担连带责任。这种责任承担与是否进行工商备案无关。
未备案股东的特殊责任：
- 身份认定风险：如果未备案股东的身份在公司内部或外部存在争议，那么在债务纠纷中，该股东可能需承担更多的举证责任，以证明其股东身份和出资情况。
- 实际控制人责任：如果未备案股东实际控制了公司，并利用公司名义进行经营活动，那么在公司发生债务时，该股东可能因实际控制人的身份而被认定为需承担责任的主体。
三、建议与措施
及时备案：
- 完善手续：对于已经入股但未进行工商备案的股东，建议尽快办理备案手续，以完善股东身份公示，降低法律风险。
- 保留证据：在办理备案前，股东应保留好出资证明、股东会决议等文件，以证明其股东身份和出资情况。
风险防范：
- 了解公司状况：在入股前，股东应充分了解公司的经营状况、财务状况和法律风险，以避免因公司问题而承担不必要的责任。
- 签订协议：股东之间可以签订股东协议，明确各自的权利义务和责任承担方式，以在发生纠纷时提供有力的法律依据。
总结来说，入股未进行工商备案并不意味着入股行为完全无效，但在股东身份认定和股权行使上可能存在一定风险。在公司发生债务时，未备案股东仍可能需承担相应责任。因此，建议股东及时办理工商备案手续，并加强风险防范意识。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。