关于公务员停薪留职期满后的处理，这通常取决于具体的政策规定以及停薪留职期间的具体情况。以下是一些一般性的处理原则和可能的情况，供您参考：

一、一般性处理原则

1. 审查与评估：停薪留职期满后，首先会对公务员在停薪留职期间的表现、是否遵守相关规定等进行审查与评估。

2. 工资调整与补发：根据人发〔1999〕134号文件的规定，若公务员在停职审查期间遇国家规定调整工资，其工资调整暂缓执行。待审查结束有结论后，若未受到行政处罚或行政纪律处分，将按国家规定予以补调和补发工资。这一原则同样适用于停薪留职期满后的处理，即根据审查结果决定是否补发工资及调整工资档次。

3. 编制与人事关系：停薪留职期满后，公务员的编制和人事关系将根据具体情况进行处理。若停薪留职前编制人事工资等手续关系完善，且已进人力资源监管平台，并在原单位正常上班的，可能只需补缴相关费用并经批准后即可返回单位正常上班。

二、可能的具体情况及处理

1. 经批准的停薪留职：

   • 若公务员的停薪留职是经过组织人事编制财政部门批准的，且停薪留职前编制人事工资等手续关系完善，已进人力资源监管平台，并在原单位正常上班，那么期满后，通常需要补缴停薪留职期间应缴的社会养老保险、职业年金等费用（国家部分和个人部分都由其本人缴纳），并经主管组织人事的县级领导批准同意后，返回单位正常上班。

2. 自行办理的停薪留职：

   • 对于在特定时间（如2014年11月之前）之前自行办理的停薪留职人员，若其停薪留职前编制人事工资等手续关系完善，已进人力资源监管平台，并在原单位正常上班，处理方式可能与经批准的停薪留职类似，但可能还会对本人和同意其停薪留职的时任单位主要领导进行谈话提醒、批评教育。
   • 若自行办理的停薪留职人员在停薪留职前编制人事工资等手续关系不完善，或未在原单位正常上班，期满后若未主动写出辞职申请，可能会面临立案调查、责令辞退或开除等处理。

3. 未按规定处理的后果：

   • 若停薪留职期满后，公务员未按规定补缴相关费用、未返回单位正常上班或未主动写出辞职申请，可能会面临立案调查、责令辞退或开除等严重后果。同时，其所在单位的主要领导也可能因管理不善而受到责任追究。

三、特殊注意事项

• 工龄计算：停薪留职的时间通常不计入工龄，这可能会影响公务员的退休待遇等。
• 政策变动：由于政策可能随时间而变动，因此具体处理方式还需以最新政策规定为准。若上级有关部门对停薪留职人员问题出台了新的处理政策规定，应以新政策规定为准。

综上所述，公务员停薪留职期满后的处理是一个复杂而细致的过程，需要根据具体情况和政策规定进行具体分析。建议您在面临此类情况时，及时咨询所在单位的人事部门或相关政策制定部门，以获取最准确、最权威的信息和指导。