签就业协议时公司有两条异常记录，一般不会直接影响毕业。下面我详细解释一下这个结论：

1. 就业协议与毕业的关系：

   • 就业协议是毕业生与用人单位之间签订的一种意向性协议，主要明确双方在未来的就业意向和条件。
   • 毕业则是由学校根据学生的学习情况、学分完成度等因素来决定的，与就业协议无直接关联。

2. 公司异常记录的影响：

   • 公司异常记录可能涉及公司的经营状况、信用状况等，这些主要是对公司本身的影响。
   • 对于毕业生来说，就业协议中的公司异常记录可能会影响到他们对公司的选择和判断，但并不会直接影响到他们的毕业资格。

3. 可能存在的间接影响：

   • 如果公司的异常记录严重到影响公司的正常运营，甚至导致公司无法履行就业协议中的义务，那么毕业生可能会面临就业协议无法履行的情况。但这依然不会直接影响到毕业，只是可能会影响到毕业生的就业计划。
   • 在某些极端情况下，如果学校的毕业要求中包含了与就业相关的条件（如必须签订就业协议才能毕业），且学校对就业协议中的公司有一定的审核要求，那么公司的异常记录可能会间接影响到毕业生的毕业。但这种情况非常罕见，且具体还需根据学校的毕业要求来确定。

综上所述，签就业协议时公司有两条异常记录，一般不会直接影响毕业。但如果你对具体情况有疑虑，建议咨询你所在学校的就业指导部门或相关负责老师，以获取更准确的解答。