案件承办人确实对卷宗材料负责。这一责任主要体现在以下几个方面：

首先，从立卷的角度来看，根据相关执法案卷管理制度，行政处罚、行政许可、政府信息依申请公开以及移送其他部门的案卷，均由案件承办人负责立卷。这意味着案件承办人需要按照规定的顺序和要求，将与案件有关的材料汇集成卷，确保卷宗的完整性和规范性。

其次，在案件办理过程中，案件材料也由案件承办人保管。这要求案件承办人必须妥善保管卷宗材料，防止材料丢失、损毁或泄露，确保案件材料的完整性和安全性。

再者，对于已经办结的行政执法案件，案件承办人需要在规定的时间内（如10个工作日内或每月25日，具体根据制度要求）完成立卷归档工作。这一环节同样要求案件承办人对卷宗材料负责，确保归档的卷宗材料符合规定要求，便于后续查阅和管理。

此外，如果案件承办人在案卷管理过程中违反规定，造成后果的，将按照相关责任追究制度对有关人员进行责任追究。这进一步强调了案件承办人对卷宗材料负责的重要性。

综上所述，案件承办人在卷宗材料的立卷、保管、归档等各个环节都承担着重要责任，必须严格按照相关制度要求执行，确保卷宗材料的完整性、规范性和安全性。