结论：物业要求整改二楼飘窗是否违法，需根据具体情况判断。若飘窗建设违反了相关法律法规、小区规划或物业管理规定，则物业的要求是合法的；反之，若飘窗建设合法合规，则物业的要求可能缺乏法律依据。
分析如下：
法律法规层面：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，任何建设活动都应当符合城乡规划，未经批准擅自改变建筑结构或外观可能构成违法建设。若二楼飘窗的建设未经相关部门批准，或违反了当地的城乡规划要求，那么物业要求整改是合法的，因为物业有责任维护小区的规划秩序和公共利益。
小区规划层面：
- 小区规划通常会在购房时作为合同的一部分提供给业主，其中会明确建筑的结构、外观、使用功能等。若二楼飘窗的建设违反了小区规划，改变了建筑外观或影响了其他业主的合法权益，那么物业要求整改也是合理的。因为物业有责任执行小区规划，维护小区的整体环境和秩序。
物业管理规定层面：
- 物业管理规定是小区内部的管理规范，通常包括建筑安全、环境卫生、公共秩序等方面的内容。若二楼飘窗的建设违反了物业管理规定，如影响了建筑安全、造成了安全隐患或影响了小区的整体美观等，那么物业要求整改也是符合规定的。因为物业有责任执行物业管理规定，保障小区的安全和秩序。
合法合规情况下的处理：
- 若二楼飘窗的建设完全合法合规，没有违反任何法律法规、小区规划或物业管理规定，那么物业要求整改可能缺乏法律依据。在这种情况下，业主可以与物业进行沟通协商，要求物业提供整改的具体理由和依据。若物业无法提供合理的理由和依据，业主可以拒绝整改，并考虑通过法律途径维护自己的合法权益。
建议：
- 核实情况：首先，业主应核实二楼飘窗的建设是否违反了相关法律法规、小区规划或物业管理规定。可以通过查阅相关法律法规、小区规划图纸或物业管理规定来确认。
- 与物业沟通：若确认飘窗建设合法合规，业主应与物业进行沟通协商，要求物业提供整改的具体理由和依据。若物业无法提供合理的理由和依据，业主可以拒绝整改。
- 寻求法律帮助：若与物业沟通无果，或物业坚持要求整改且理由不充分，业主可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能后果：
- 若业主拒绝整改且物业无法提供合法依据，物业可能会采取进一步措施，如上报相关部门或采取法律手段。因此，业主在拒绝整改前应确保自己的权益得到充分保障。
- 若业主最终确认飘窗建设违法或违规，且拒绝整改，可能会面临法律责任，如罚款、拆除等。因此，业主应谨慎对待物业的整改要求，确保自己的建设活动合法合规。
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