毕业生是可以签订双方协议的，这一流程已经得到了教育部的支持和推广。以下是对此问题的详细解答：

首先，为了优化高校毕业生的求职就业服务流程，并方便用人单位与毕业生进行网上签约，教育部已经开通了全国高校毕业生毕业去向登记与网上签约平台。这一平台为毕业生和用人单位提供了一个便捷、高效的签约渠道。

关于签约的具体形式，根据教育部的相关通知，自2023届毕业生起，网签就业协议书统一使用两方协议。这意味着，在网签平台上，毕业生和用人单位可以直接签订两方协议，无需再涉及第三方（如学校作为见证方）的参与。当然，如果学校或用人单位有特殊需求，仍可以选择使用三方协议进行线下签约，但协议书模板需参考网签平台协议书样式，并结合自身实际和工作需要进行修改调整。

对于双方协议的效力，网上签约的电子就业协议书与纸质三方协议书具有相同的法律效力。这意味着，无论是通过网签平台签订的两方协议，还是线下签订的三方协议，只要内容合法、双方自愿，都具有法律约束力。

在实际操作中，用人单位需要在网签平台上注册后，通过平台搜索已注册拟签约的毕业生，并在线发送签约邀请。毕业生同意后，院校审核通过即完成签约。整个签约流程全部线上完成，减少了邮寄、盖章等环节，有效缩短了办理时间。

综上所述，毕业生是可以签订双方协议的，并且这一流程已经得到了教育部的支持和推广。通过全国高校毕业生毕业去向登记与网上签约平台，毕业生和用人单位可以更加便捷、高效地完成签约流程。