已经履行完毕的合同，一般情况下不能仅以审计结果为由要求返还已付款，但具体还需根据合同条款、审计目的及双方约定等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同履行完毕的基本原则
合同履行完毕，意味着双方已经按照合同约定完成了各自的权利和义务。在合同法中，有一个基本原则叫做“合同严守原则”，即合同一旦成立并生效，双方应当严格遵守，不得随意变更或解除。因此，在合同已经履行完毕的情况下，如果没有法定或约定的理由，一方不能单方面要求返还已付款。
二、审计结果作为要求返还已付款的依据
合同中有明确约定：
- 如果合同中明确约定了以审计结果作为付款或结算的依据，并且约定了在特定情况下（如审计结果显示多付款项）可以要求返还，那么在这种情况下，一方可以根据审计结果要求返还已付款。但这种情况需要合同中有明确的、具体的约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定。
合同中没有明确约定：
- 如果合同中没有明确约定以审计结果作为付款或结算的依据，或者虽然约定了审计，但并未约定可以根据审计结果要求返还已付款，那么一方不能仅凭审计结果要求返还。因为审计结果本身并不直接产生法律上的返还义务，除非双方对此有明确的约定或法律有特别规定。
三、可能的法律后果及建议
法律后果：
- 如果一方在没有法定或约定理由的情况下，仅凭审计结果要求返还已付款，可能构成违约或不当得利。违约方可能需要承担违约责任，如赔偿损失、支付违约金等；不当得利方则可能需要返还取得的利益。
建议：
- 审查合同条款：首先，双方应仔细审查合同条款，特别是关于付款、结算和审计的约定，以确定是否有可以根据审计结果要求返还已付款的条款。
- 协商解决：如果合同中有相关约定或双方对此存在争议，建议通过协商的方式解决。协商可以更加灵活、高效地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
- 寻求法律途径：如果协商无果，双方可以考虑通过法律途径解决争议。这可能包括提起诉讼或申请仲裁等。在法律程序中，双方需要提供充分的证据来支持自己的主张。
四、特殊情况下的考虑
- 审计的合法性和公正性：如果审计过程存在违法或不当行为，导致审计结果不公正或不可靠，那么一方可能不能仅凭该审计结果要求返还已付款。在这种情况下，可能需要重新进行审计或采取其他措施来确保结果的公正性和可靠性。
- 法律法规的特别规定：在某些特定情况下，法律法规可能对合同的履行和结算有特别规定。例如，在建设工程合同中，可能存在关于工程价款结算的特别规定。在这种情况下，双方需要遵守相关法律法规的规定。
综上所述，已经履行完毕的合同能否以审计结果为由要求返还已付款，需要根据合同条款、审计目的及双方约定等因素综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。