结论：原告能否申请执行被执行人在挂靠公司的债权，需分情况讨论，关键在于该债权是否属于被执行人的责任财产范围，以及是否满足执行条件。具体分析如下：

1. 若被执行人对挂靠公司的债权明确且无争议
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，被执行人名下的财产（包括到期债权）均属于责任财产范围，法院可依法执行。此时，原告作为申请执行人，可向法院申请执行该债权。具体流程为：

   • 法院向挂靠公司发出《履行到期债务通知书》，要求其直接向原告履行债务；
     
   • 若挂靠公司在指定期限内未提出异议且未履行，法院可裁定对其强制执行；
     
   • 若挂靠公司提出异议（如债权不存在、已清偿等），法院不得直接执行，原告需通过代位权诉讼等途径另行主张权利。

2. 若被执行人对挂靠公司的债权存在争议或未到期

   • 债权存在争议：如挂靠公司主张债权已消灭、金额不符等，法院会因债权不明确而裁定不予执行。原告需先通过诉讼确认债权归属及金额后，再申请执行。
     
   • 债权未到期：根据《民法典》及执行规定，未到期债权因不具有现实可执行性，法院通常不予直接执行。但若挂靠公司同意提前清偿，或原告能证明被执行人存在恶意转移财产等情形，可能例外处理。

3. 特殊情形：挂靠关系是否影响债权执行
   若挂靠协议约定债权归属挂靠公司（如实际施工人以挂靠公司名义对外经营），需区分债权性质：

   • 名义债权：若债权虽以挂靠公司名义享有，但实际权利人为被执行人（如实际施工人），法院可能穿透挂靠关系执行；
     
   • 真实债权：若债权确属挂靠公司所有，被执行人仅享有内部结算权（如工程款需扣除管理费后支付），则原告仅能申请执行被执行人实际可得的份额。

建议：原告申请执行前，应通过律师调查令、审计等方式核实债权真实性及金额，并评估挂靠协议对债权归属的影响。若遇挂靠公司异议，需及时通过诉讼确认权利，避免执行程序拖延。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。