结论：违规建设在业主闹事期间补办证件，是否违法需分情况讨论，关键在于建设行为本身的合法性及补办证件的合规性。以下从不同角度进行分析：

1. 建设行为本身的合法性

• 若建设行为本身违法：根据《城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或未按照规划许可证规定建设的，属违法建设。即使后续补办证件，若建设行为本身违反规划（如超面积、超层高、改变用途等），仍可能面临行政处罚（如罚款、限期拆除、没收违法所得等）。补办证件不能改变违法建设的性质，仅可能减轻处罚或作为整改措施的一部分。
• 若建设行为本身合法：若建设符合规划要求，仅因手续不全（如未及时办理许可证）被认定为“违规建设”，补办证件后，建设行为即合法化，不再构成违法。但需注意，补办证件需符合法定程序，若通过不正当手段（如贿赂、虚假材料）取得，可能涉及其他违法行为（如行贿罪、伪造国家机关证件罪）。

2. 补办证件的合规性

• 合规补办：若补办证件的程序合法（如提交完整材料、符合规划要求、缴纳罚款等），且建设行为本身合法，则补办后不再违法。但需注意，补办证件可能需承担行政责任（如补缴费用、接受行政处罚），但不影响建设行为的合法性。
• 违规补办：若补办证件过程中存在违法行为（如伪造材料、行贿、利用关系违规审批等），则补办行为本身可能构成违法，甚至犯罪。此时，不仅建设行为可能被认定为违法，相关责任人还可能面临刑事处罚（如行贿罪、伪造国家机关证件罪）。

3. 业主闹事的影响

• 业主闹事本身不改变建设行为的合法性，但可能促使相关部门加快处理或严格审查。若建设行为违法，业主闹事可能推动行政机关依法查处；若建设行为合法，业主闹事可能促使开发商或建设方加快补办手续，以平息纠纷。
• 需注意，业主闹事需在法律框架内进行，若采取过激行为（如破坏财物、威胁他人安全等），可能构成违法（如寻衅滋事罪、故意毁坏财物罪），需承担相应法律责任。

4. 法律建议

• 对建设方：若建设行为合法，应尽快补办证件，完善手续；若建设行为违法，应主动整改（如拆除超建部分、缴纳罚款等），避免行政处罚或刑事责任。
• 对业主：若认为建设行为违法，可通过合法途径维权（如向规划部门投诉、提起行政诉讼等），避免采取过激行为。
• 双方：建议通过协商、调解等方式解决纠纷，必要时可寻求法律帮助，以维护自身合法权益。

总结：违规建设补办证件是否违法，需结合建设行为本身的合法性及补办证件的合规性综合判断。若您涉及此类纠纷，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业法律意见。