项目第三方协议的出具方并非固定由甲方或乙方决定，而是取决于协议的具体内容、目的以及双方协商的结果。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

1. 协议内容与目的：

   • 如果项目第三方协议主要是为了明确甲方与第三方之间的权利义务关系，那么该协议可能更倾向于由甲方出具，以便甲方能够更好地控制协议内容，确保其利益得到保障。
   • 反之，如果协议主要是为了明确乙方与第三方之间的权利义务关系，那么乙方出具协议可能更为合适。
   • 在某些情况下，协议可能涉及甲方、乙方和第三方三方的共同权利义务，此时协议可能由三方共同协商制定，或者由其中一方起草后经三方共同确认。

2. 双方协商与约定：

   • 在实际操作中，项目第三方协议的出具方往往是通过双方协商确定的。甲方和乙方可以根据项目的实际情况、各自的需求和利益，以及第三方的意愿，共同决定由谁来出具协议。
   • 协商过程中，双方可以就协议的内容、条款、格式等进行充分讨论，以确保协议能够满足各方的需求，并保障各方的权益。

3. 法律与合规性要求：

   • 无论由哪一方出具协议，都必须确保协议的内容符合法律法规的要求，不得违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 协议中的条款应当明确、具体，避免模糊不清或产生歧义，以确保协议的履行和争议解决。

4. 实际操作建议：

   • 在项目第三方协议的制定过程中，建议甲方和乙方都积极参与，共同协商确定协议的内容和条款。
   • 如果可能的话，可以邀请第三方参与协议的制定过程，以确保第三方的权益得到充分保障。
   • 在协议签订前，建议各方都仔细阅读协议内容，确保理解并同意协议中的各项条款。

举例说明：

• 假设甲方是一个建筑公司，乙方是一个材料供应商，双方需要与一个运输公司（第三方）签订运输协议。在这种情况下，协议可能由甲方或乙方出具，具体取决于谁更熟悉运输业务、谁更能够控制运输成本等因素。如果甲方更熟悉运输业务，那么可能由甲方出具协议；如果乙方与运输公司有长期合作关系，那么可能由乙方出具协议。
• 另一种情况是，甲方、乙方和第三方共同参与一个合作项目，需要签订一份三方协议。在这种情况下，协议可能由三方共同协商制定，或者由其中一方起草后经三方共同确认。

总结与建议： 项目第三方协议的出具方并非固定不变，而是应根据协议的具体内容、目的以及双方协商的结果来确定。在制定协议时，建议各方都积极参与、充分协商，并确保协议内容符合法律法规的要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。