关于“挂靠工程罚款，罚款由谁承担”的问题，这主要取决于挂靠行为中涉及的具体违法主体以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细解答：

一、挂靠行为中的违法主体

在工程挂靠中，通常涉及两个主要违法主体：一是挂靠方，即没有相应资质的单位或个人；二是被挂靠方，即允许他人以本单位名义承揽工程的有资质的建筑施工企业。

二、罚款的承担主体

1. 被挂靠方：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》及《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，建筑施工企业或单位允许他人以本单位名义承揽工程的，将被视为违法行为，并面临责令改正、没收违法所得及罚款等处罚。罚款数额根据违法情节的严重性确定，对施工单位的罚款可达工程合同价款的2%至4%。因此，在这类情况下，罚款主要由被挂靠方承担。

2. 挂靠方：

   • 虽然直接的法律处罚可能主要针对被挂靠方，但挂靠方作为实际承揽工程的主体，若其行为导致工程质量问题或其他违法行为，也可能面临相应的法律责任。例如，若因挂靠导致的工程质量问题造成损失，挂靠方与被挂靠方需承担连带赔偿责任。此外，若挂靠方在挂靠过程中存在其他违法行为（如偷工减料、弄虚作假等），还可能面临单独的行政处罚或刑事责任。

3. 相关责任人员：

   • 根据《注册建造师管理规定》等相关规定，若注册建造师允许他人以自己的名义从事执业活动，也将面临警告、罚款等处罚。因此，在挂靠行为中涉及的相关责任人员（如项目经理、技术负责人等）也可能成为罚款的承担主体。

三、特殊情况下的罚款承担

• 在某些特殊情况下，如挂靠行为导致重大安全事故或其他严重后果时，责任人（包括挂靠方、被挂靠方及相关责任人员）可能面临更严厉的行政处罚或刑事责任。此时，罚款的承担将根据具体违法情节和法律法规的规定来确定。

四、建议与总结

• 严格遵守法律法规：所有从事工程建设活动的单位和个人应严格遵守相关法律法规，坚决杜绝工程挂靠等违法行为的发生。
• 加强监管与打击力度：相关部门应加强监管力度，对挂靠行为进行严厉打击，以保障建筑市场的健康发展。
• 明确责任与风险：在挂靠行为中，各方应明确各自的责任与风险，避免因违法行为而承担不必要的法律后果。

综上所述，挂靠工程罚款的承担主体主要取决于违法主体及具体违法情节。在大多数情况下，罚款主要由被挂靠方承担；但挂靠方及相关责任人员也可能因违法行为而面临相应的法律责任。因此，建议所有从事工程建设活动的单位和个人严格遵守法律法规，共同维护建筑市场的公平竞争秩序和工程质量的安全可靠。