结论：刑满后又被追究剩余款项，在特定情况下是合法的。这主要涉及到刑事判决中罚金、没收财产等财产刑的执行，以及是否构成新的犯罪或需要继续追缴违法所得的问题。以下从几个方面进行详细分析：
刑事判决中的财产刑执行：
- 在刑事判决中，除了对犯罪分子判处主刑（如有期徒刑、无期徒刑等）外，还可能同时判处附加刑，如罚金、没收财产等。这些附加刑的执行是独立的，不受主刑执行完毕的影响。
- 如果判决中明确规定了需要缴纳的罚金数额或需要没收的财产范围，那么犯罪分子在刑满释放后，仍然需要履行这些财产刑的义务。若未履行，法院有权继续追缴。
违法所得的追缴：
- 在诈骗等犯罪中，犯罪分子通过犯罪行为获得的财物，属于违法所得。根据法律规定，违法所得应当予以追缴或者责令退赔。
- 如果犯罪分子在刑满释放后，仍未退赔全部违法所得，那么司法机关有权继续追缴剩余的款项。这是为了维护法律的公正和受害者的合法权益。
是否构成新的犯罪：
- 如果犯罪分子在刑满释放后，又实施了新的诈骗行为，并获取了新的财物，那么这部分财物当然属于新的违法所得，应当予以追缴。
- 此外，如果犯罪分子在刑满释放后，以非法占有为目的，隐瞒、转移、变卖、毁损已被司法机关查封、扣押、冻结的财产，情节严重的，还可能构成新的犯罪，如拒不执行判决、裁定罪等。
具体案例分析：
- 在您提到的案例中，被告最初因诈骗40万被起诉，但经审核后以五万被判服刑。这可能意味着法院在判决时，只认定了五万为犯罪所得，或者只判决了五万的罚金。然而，这并不意味着剩余的35万就无需追缴。
- 如果这35万仍然属于违法所得，且未在判决中明确处理，那么司法机关在刑满释放后继续追缴是合法的。此外，如果被告在服刑期间或刑满释放后，有新的诈骗行为或拒不执行判决、裁定的行为，那么也可能面临新的法律追究。
建议：
- 如果您或您身边的人面临类似情况，建议积极配合司法机关的工作，主动退赔违法所得，以减轻法律后果。
- 如果对司法机关的追缴行为有异议，可以依法提出申诉或申请复议，但应当通过合法途径表达诉求，避免采取过激行为。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑法》第六十四条：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。”
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律法规也规定了司法机关在追缴违法所得方面的权力和程序。
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