办理行政案件超期，主要违反了《中华人民共和国行政处罚法》以及相关行政程序规定中关于办案期限的要求。以下是对此问题的详细分析：

1. 违反《中华人民共和国行政处罚法》的规定：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》第六十条：“行政机关应当自行政处罚案件立案之日起九十日内作出行政处罚决定。法律、法规、规章另有规定的，从其规定。” 若行政机关在办理行政案件时超出了这一期限，即构成了对法定办案期限的违反。

2. 违反相关行政程序规定：

   • 除了《行政处罚法》外，不同领域的行政案件还可能受到特定行政程序规定的约束。例如，在治安管理处罚领域，《中华人民共和国治安管理处罚法》第九十九条规定：“公安机关办理治安案件的期限，自受理之日起不得超过三十日；案情重大、复杂的，经上一级公安机关批准，可以延长三十日。” 若公安机关在办理治安案件时超出了这一期限，同样构成了对法定办案期限的违反。

3. 法律后果：

   • 行政机关超期办理行政案件，可能面临被上级行政机关责令改正、通报批评等行政责任。
   • 对于因超期办理而给当事人造成损失的，行政机关还可能承担相应的赔偿责任。
   • 在极端情况下，如果超期办理行政案件的行为严重违反了法定程序，且影响了案件的公正处理，该行政行为还可能被法院判决撤销或确认违法。

4. 实际操作建议：

   • 行政机关在办理行政案件时，应严格遵守法定办案期限，确保案件的及时、公正处理。
   • 如因特殊情况需要延长办案期限的，应及时按照法定程序报请批准，并告知当事人。
   • 当事人在认为行政机关超期办理行政案件时，可以依法向上级行政机关投诉、举报，或寻求法律救济途径，如申请行政复议或提起行政诉讼。

总结来说，办理行政案件超期主要违反了《中华人民共和国行政处罚法》以及相关行政程序规定中关于办案期限的要求。行政机关应严格遵守这些规定，确保案件的及时、公正处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。