建设工程规划许可的建设单位可以是自然人和公司联合作为申请主体，但需满足一定条件并遵循特定程序。以下从法律背景、申请条件、程序要求及可能后果几个方面进行详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国城乡规划法》及相关规定，建设工程规划许可证是建设单位或者个人进行工程建设活动，依法向城乡规划主管部门提出申请，由城乡规划主管部门依据城市、镇总体规划，审核建设工程是否符合规划要求后，准予建设的法律凭证。这里的“建设单位”并未明确限定为单一主体，因此，从法律条文本身来看，并未排除自然人和公司联合作为建设单位的可能性。

申请条件

1. 联合申请主体资格：自然人和公司作为联合申请主体时，需确保双方均具备相应的民事权利能力和民事行为能力。自然人需具备完全民事行为能力，公司则需依法设立并有效存续。
2. 共同意愿与协议：自然人和公司需就联合申请建设工程规划许可达成共同意愿，并签订书面协议，明确双方的权利、义务及责任分担等事项。
3. 符合规划要求：联合申请的建设工程需符合城乡规划要求，包括用地性质、建筑密度、容积率、绿地率等规划指标。

程序要求

1. 提交申请材料：自然人和公司需共同向城乡规划主管部门提交建设工程规划许可申请，并附上相关证明材料，如身份证明、公司营业执照、联合申请协议、建设工程设计方案等。
2. 审核与公示：城乡规划主管部门将对申请材料进行审核，并在必要时进行公示，征求公众意见。公示期间，任何单位和个人均有权提出异议。
3. 核发许可证：经审核符合规划要求的，城乡规划主管部门将核发建设工程规划许可证，并注明建设单位为自然人和公司联合。

可能后果

1. 合法合规建设：若自然人和公司联合申请并获得建设工程规划许可证后，按照许可证要求进行建设，则属于合法合规行为，不会面临法律处罚。
2. 违法建设风险：若未取得建设工程规划许可证或未按照许可证要求进行建设，则可能面临责令停止建设、限期改正、罚款等行政处罚，甚至可能面临拆除违法建筑的严重后果。

建议：在联合申请建设工程规划许可时，自然人和公司应充分了解相关法律法规及程序要求，确保申请材料的真实性和完整性。同时，双方应签订详细的联合申请协议，明确各自的权利、义务及责任分担等事项，以避免后续纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。