当多个公司作为劳动仲裁的被申请人时，劳动者可按照以下步骤进行起诉（或申请仲裁及后续诉讼）：

1. 明确仲裁请求与事实依据
   首先需梳理与各公司之间的劳动关系事实，包括但不限于：

   • 劳动合同签订主体（是否与多家公司存在关联劳动关系）；
     
   • 工资发放记录（由哪家公司支付）；
     
   • 工作内容与工作地点（是否涉及多家公司交叉用工）；
     
   • 社保缴纳情况（是否由不同公司分别缴纳）。
     关键点：需证明各公司存在共同用工、关联用工或混同用工的事实，例如：
     
   • 实际控制人相同；
     财务、人事管理混同；
     工作地点、工作内容高度重叠。

2. 选择仲裁被申请人主体

   • 情形一：关联公司混同用工
     若多家公司存在人格混同（如实际控制人相同、财务混同、业务混同），可依据《劳动争议调解仲裁法》第二十二条，将关联公司列为共同被申请人，要求其承担连带责任。
     示例：A公司与B公司实际控制人相同，劳动者同时为两家公司工作，工资由A公司发放但社保由B公司缴纳，此时可同时起诉两家公司。
     
   • 情形二：劳务派遣或外包关系
     若涉及劳务派遣，需区分用工单位与用人单位：
     
     • 用人单位（派遣公司）未依法支付工资、社保的，劳动者可仅起诉派遣公司；
       
     • 用工单位（实际工作单位）造成劳动者损害的（如工伤、加班费未支付），可同时起诉派遣公司与用工单位。
       法律依据：《劳动合同法》第九十二条。

3. 提交仲裁申请材料

   • 必备材料：
     
     • 仲裁申请书（需列明所有被申请人名称、地址、法定代表人信息）；
       
     • 劳动者身份证明（身份证复印件）；
       
     • 证据材料（劳动合同、工资条、考勤记录、社保缴纳记录、工作证等）；
       
     • 关联关系证据（如企业信用信息公示报告、银行流水、工作安排记录等）。
       
   • 注意事项：
     
     • 需向有管辖权的劳动仲裁委员会提交申请（通常为劳动合同履行地或用人单位所在地）；
       
     • 若多家公司所在地不同，可选择对劳动者最有利的管辖地（如工资发放地、实际工作地）。

4. 仲裁裁决后的诉讼程序

   • 若对仲裁裁决不服，可在收到裁决书之日起15日内向法院提起诉讼；
     
   • 诉讼阶段仍可追加或变更被告（如发现新证据证明其他公司应承担责任）；
     
   • 法院审理时，需重点举证关联公司混同用工的事实，法院可能依据《公司法》第二十条（法人人格否认制度）判决关联公司承担连带责任。

风险提示：

• 若无法证明多家公司存在混同用工或关联关系，仲裁委/法院可能仅支持对直接用工主体的诉求；
  
• 涉及跨地区用工时，需注意不同地区劳动政策差异（如加班费基数、经济补偿标准）。

建议：

• 尽快收集并固定证据（如工资流水、工作安排记录、社保缴纳证明等）；
  
• 若涉及复杂关联关系，可委托律师协助梳理法律关系及举证策略。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。