合同制工作人员起诉用人单位确实存在时效限制，这一限制主要依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、时效的基本规定
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这意味着，合同制工作人员在发现自己的权益受到侵害后，需要在一年内提起仲裁申请，否则可能会丧失胜诉权。这一时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
二、时效的中断与中止
时效中断：在仲裁时效期间内，如果因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断，那么从中断时起，仲裁时效期间将重新计算。这为合同制工作人员提供了一定的灵活性，允许他们在特定情况下延长提起仲裁的时间。
时效中止：如果因不可抗力或者有其他正当理由，导致当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效将中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。这一规定考虑了不可抗力等特殊情况对当事人行使权利的影响，体现了法律的公平和合理。
三、特殊情况下的时效规定
对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的情况，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制。但是，如果劳动关系终止，那么劳动者应当自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。这一规定为劳动者在劳动关系存续期间因拖欠工资等劳动报酬问题提供了更长的保护期限。
四、法律建议
及时维权：合同制工作人员在发现自己的权益受到侵害后，应尽快采取行动，包括与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或提起仲裁申请等。避免因为拖延时间而丧失胜诉权。
保留证据：在维权过程中，合同制工作人员应保留好相关证据，如劳动合同、工资单、工作记录等。这些证据将有助于证明自己的权益受到侵害的事实和程度。
咨询专业律师：如果合同制工作人员对法律程序或自己的权益存在疑问，可以向我咨询。作为专业律师，我可以提供具体的法律建议和帮助，确保他们的权益得到有效维护。
综上所述，合同制工作人员起诉用人单位确实存在时效限制，但这一限制并非绝对不可突破。在特定情况下，如时效中断或中止等，合同制工作人员仍有可能在超过一年后提起仲裁申请并获得胜诉。然而，为了确保自己的权益得到有效维护，合同制工作人员应尽可能在时效期间内提起仲裁申请，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。