在民事案件已经结算后，审计中发现有问题，可以采取以下措施：

1. 核查审计问题的性质与严重性：

   • 首先，需要明确审计中发现的问题具体是什么，是计算错误、遗漏事项，还是存在欺诈、虚假陈述等违法行为。问题的性质将直接影响后续的处理方式和法律责任。
   • 如果问题仅涉及计算错误或遗漏事项，且双方对结算结果有争议，可以通过协商、调解或重新审计等方式解决。
   • 如果问题涉及欺诈、虚假陈述等违法行为，则可能涉及法律责任的追究，需要采取更严肃的措施。

2. 协商与调解：

   • 在问题性质明确后，双方可以尝试通过协商或调解的方式解决争议。协商和调解具有灵活性和高效性，可以避免不必要的法律诉讼。
   • 如果双方能够达成一致意见，可以签订补充协议或和解协议，对原结算结果进行修正或补充。

3. 重新审计或鉴定：

   • 如果双方对审计结果存在争议，且无法通过协商或调解解决，可以考虑委托第三方机构进行重新审计或鉴定。
   • 重新审计或鉴定应由具有相应资质和经验的机构进行，以确保结果的客观性和准确性。

4. 法律诉讼：

   • 如果问题涉及严重的违法行为，或者双方无法通过协商、调解或重新审计等方式解决争议，可以考虑通过法律诉讼的方式解决。
   • 在提起诉讼前，应收集充分的证据，包括审计报告、结算协议、相关交易记录等，以支持自己的主张。
   • 诉讼过程中，应遵循法律程序，积极配合法院的调查和审理工作，以维护自己的合法权益。

5. 法律后果与责任追究：

   • 如果审计中发现的问题涉及违法行为，如欺诈、虚假陈述等，相关责任人可能面临法律责任的追究，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
   • 在处理此类问题时，应充分考虑法律后果，确保自己的行为符合法律法规的要求，避免不必要的法律风险。

针对不同情况的具体建议：

• 若问题轻微且双方无争议：可以直接通过协商或补充协议的方式解决，无需启动复杂的法律程序。
• 若问题涉及计算错误或遗漏：且双方对结算结果有争议，可以委托第三方机构进行重新审计或鉴定，以明确责任并修正结算结果。
• 若问题涉及违法行为：应立即停止相关行为，并收集证据准备法律诉讼，以维护自己的合法权益并追究相关责任人的法律责任。

在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，遵循法律程序，确保自己的行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。