结论概述：针对“全运会皮划艇男子500米决赛赛事组织方对违规行为处理程序是否合法”的问题，需结合赛事组织方的具体处理程序、相关法律法规及行业规范进行综合判断。由于新闻背景未直接提及违规行为及处理程序的具体内容，以下分析将基于一般性原则和假设性场景展开。
一、赛事组织方处理违规行为的法律依据
《体育赛事活动管理办法》：该办法规定了体育赛事活动的组织、管理、监督等方面的基本要求，包括赛事组织方对违规行为的处理权限和程序。赛事组织方在制定内部规则时，应确保这些规则不违反国家法律法规，并明确违规行为的认定标准和处理程序。
《中华人民共和国体育法》：该法规定了体育活动的组织、开展、监督等方面的基本原则，强调公平、公正、公开的原则。赛事组织方在处理违规行为时，应遵循这些原则，确保处理程序的合法性和公正性。
二、赛事组织方处理违规行为的合法程序
规则制定与公示：赛事组织方应在赛前制定详细的竞赛规则，包括违规行为的认定标准和处理程序，并通过官方渠道向所有参赛者和观众公示。这是确保处理程序合法性的前提。
违规行为认定：在赛事过程中，赛事组织方应设立专门的监督机构或人员，负责监控比赛过程，及时发现并认定违规行为。认定过程应遵循客观、公正的原则，确保事实清楚、证据确凿。
处理程序执行：一旦违规行为被认定，赛事组织方应按照预先制定的处理程序进行处理。处理程序应包括通知违规者、听取其陈述和申辩、作出处理决定等环节。处理决定应明确、具体，并告知违规者有权申请复议或提起诉讼。
公开透明：赛事组织方应及时将处理结果向所有参赛者和观众公示，以维护比赛的公正性和透明度。同时，应保护违规者的隐私权，避免不必要的公开曝光。
三、假设性场景分析
假设在全运会皮划艇男子500米决赛中，某选手被指控违规使用器材。赛事组织方在处理此事件时，应遵循以下程序：
立即暂停比赛：在发现违规行为后，赛事组织方应立即暂停比赛，确保比赛的公正性不受影响。
调查取证：赛事组织方应迅速成立调查组，对违规行为进行调查取证。调查过程应全面、客观，确保事实清楚、证据确凿。
通知违规者：在调查结束后，赛事组织方应通知违规者，告知其违规事实、处理依据和处理程序。
听取陈述和申辩：赛事组织方应给予违规者充分的机会陈述和申辩，确保其合法权益得到保障。
作出处理决定：在听取违规者的陈述和申辩后，赛事组织方应根据调查结果和竞赛规则作出处理决定。处理决定应明确、具体，并告知违规者有权申请复议或提起诉讼。
公示处理结果：赛事组织方应及时将处理结果向所有参赛者和观众公示，以维护比赛的公正性和透明度。
四、对公众的启示
遵守竞赛规则：参赛者应严格遵守竞赛规则，尊重对手和裁判，维护比赛的公正性和公平性。
了解处理程序：参赛者和观众应了解赛事组织方对违规行为的处理程序，以便在发生争议时能够维护自己的合法权益。
监督赛事组织：公众应积极监督赛事组织方的工作，确保其按照法律法规和行业规范组织比赛，维护体育事业的健康发展。
总结：赛事组织方在处理违规行为时，应遵循法律法规和行业规范，确保处理程序的合法性和公正性。由于新闻背景未提供具体违规行为及处理程序的内容，以上分析基于一般性原则和假设性场景展开。如有具体案例或疑问，可直接向我咨询。