事业单位以梅毒阳性为由辞退员工，这一做法是否合法需分情况讨论，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：

一、若员工处于梅毒感染期，且被认定影响工作或存在传染风险

1. 法律依据：根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以解除劳动合同。但这一规定的前提是，劳动者的疾病确实影响到了其工作能力，且经过医疗期后仍无法胜任工作。

2. 分析：如果员工梅毒阳性且处于活动期，确实可能因身体原因无法正常工作，或者存在将疾病传染给同事的风险，且经过医疗期治疗后仍无法胜任原工作或用人单位另行安排的工作，那么事业单位在履行了相应的程序（如提前通知、支付经济补偿等）后，有权解除劳动合同。但这一过程中，事业单位必须确保程序的合法性和公正性，不能仅凭梅毒阳性就单方面解除劳动合同。

二、若员工梅毒已治愈或处于稳定期，不影响工作且无传染风险

1. 法律依据：根据《就业促进法》和《传染病防治法》的相关规定，用人单位招用人员，除国家法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止乙肝病原携带者从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。虽然这些法律条文直接针对的是乙肝病原携带者，但其背后的立法精神——即禁止用人单位以传染病为由歧视劳动者——同样适用于梅毒等其他传染病。

2. 分析：如果员工梅毒已经治愈或处于稳定期，不影响其正常工作，且不存在传染风险，那么事业单位以梅毒阳性为由辞退员工就构成了对劳动者的歧视，违反了相关法律法规。在这种情况下，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求事业单位继续履行劳动合同或支付违法解除劳动合同的赔偿金。

三、事业单位解除劳动合同的程序要求

无论员工梅毒阳性是否影响工作，事业单位在解除劳动合同时都必须遵循一定的程序要求。这包括但不限于：

• 提前通知：事业单位应提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付员工一个月工资后解除劳动合同。
• 支付经济补偿：如果事业单位因员工患病或非因工负伤不能从事原工作而解除劳动合同，应按照员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付经济补偿。
• 听取工会或职工代表意见：在解除劳动合同前，事业单位应听取工会或职工代表的意见，确保解除劳动合同的决策过程公开、公正、透明。

四、建议与行动指南

1. 收集证据：如果你认为事业单位以梅毒阳性为由辞退你的做法不合法，首先应收集相关证据，包括劳动合同、工资单、医疗证明、辞退通知等。
2. 咨询专业律师：在收集到足够证据后，建议你咨询专业律师，了解你的权益和可能的维权途径。
3. 申请劳动仲裁：如果律师认为你的权益受到了侵害，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求事业单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。

总之，事业单位以梅毒阳性为由辞退员工是否合法需根据具体情况判断。如果你认为自己的权益受到了侵害，不要犹豫，及时收集证据并咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。