在非法经营罪案件中，股东的处理需根据其具体行为、主观明知程度及参与程度综合判断，可能面临刑事处罚或无罪处理，具体分以下情况说明：

1. 股东直接参与非法经营行为
   若股东实际参与公司非法经营活动（如决策、管理、执行等），且主观上明知公司行为违反国家规定，可能被认定为共同犯罪，以非法经营罪追究刑事责任。根据《刑法》第二百二十五条，情节严重的，处五年以下有期徒刑或拘役；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或没收财产。
   示例：股东参与制定非法经营策略、直接联系客户或资金往来，或通过分红等方式获取非法利益，均可能被认定为共犯。

2. 股东未直接参与但知情且未制止
   若股东未直接参与经营，但明知公司存在非法经营行为（如通过财务报告、会议记录等证据证明），且未采取有效措施制止或向相关部门举报，可能因“放任”行为被认定为共同犯罪中的帮助犯或从犯，承担相应刑事责任，但量刑可能轻于直接参与者。
   例外：若股东能证明已尽合理监督义务（如提出反对意见、要求整改等），可能免于刑事处罚。

3. 股东完全不知情或已尽合理审查义务
   若股东对非法经营行为完全不知情，且已履行对公司的基本审查义务（如核查营业执照、经营资质等），通常不构成犯罪。但需注意，若股东作为公司实际控制人或高管，可能因“应知而不知”被推定存在过错，需结合具体证据判断。
   提示：股东可通过定期审查公司合规文件、保留反对非法行为的证据等方式降低风险。

4. 股东已履行出资义务但未参与经营
   若股东仅履行出资义务，未参与公司实际经营或决策，且无证据证明其明知或应知非法行为，一般不承担刑事责任。但若公司财产与股东个人财产混同，可能面临民事连带责任（如公司无法清偿债务时，股东需在未出资范围内承担责任）。

行动建议：

• 若您或您的公司涉及非法经营风险，建议立即停止相关行为，并委托律师进行合规审查；
  
• 若已被立案调查，股东应积极配合调查，同时收集证明自身无罪或罪轻的证据（如未参与经营的书面记录、反对非法行为的邮件等）；
  
• 日常经营中，股东应定期审查公司资质、合同及财务状况，避免因疏忽承担法律责任。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我将结合证据为您分析风险及应对策略。